Sandøyfjorden er navnet på flere norske fjorder:
Sandøyfjorden (Sørøya) – en fjord på Sørøya i Hammerfest kommune i Finnmark. Sandøyfjorden (Tvedestrand) – en fjord i Tvedestrand og Arendal kommuner i Aust-Agder. Sandøyfjorden – en liten os ved Sandøy og Pysen i Mandal kommune i Vest-Agder. Sandøyfjorden – et sund mellom Sandøya og Rebbenesøya i Tromsø kommune i Troms.