thumb|300px|浜松駅に停車中の夜行列車（2007年1月） 夜行列車（やこうれっしゃ）とは、夜間、日付をまたいで運転される列車のことである。略して夜行（やこう）または、夜汽車（よぎしゃ）と呼ばれることもある。また、夜行列車のうち寝台車を主体とするものは寝台列車と呼ばれる。
多くの夜行列車は、深夜帯には主要駅を除いて旅客扱いを行わないが、深夜発早朝着で運行距離が短い列車では深夜であっても多数の駅で旅客扱いを行うものがある『これでいいのか 夜行列車』p.143、p.200。夜行列車の最大のメリットは、寝ている間に目的地に移動できることにある【関心アリ!】夜行列車 再び日の目／スピードより のんびり旅情／鉄道会社相次ぎ企画『読売新聞』朝刊2021年11月16日くらし面。近年、夜間運行の場合は同じく就寝中に目的地へ向かえる高速バス、所要時間が短い格安航空会社（LCC）を含む旅客機、新幹線などの高速鉄道といった競合する交通機関が台頭。高コスト・高価格の夜行列車は日本を始め、欧米、アジア、アフリカ、南米、豪など、世界的に減便傾向にある。
日本では2021年時点、定期夜行列車は1日2便を残すのみであるが、深夜を含めて複数の地域を巡る豪華観光列車や、星空や夜景、日の出を楽しんでもらうため深夜から早朝にかけて走る臨時列車が運行されている。
なお、主に日本で大晦日の初詣客のために運転される終夜運転については、ここでは述べない。
日本 歴史 新幹線開業前 日本では、全国の鉄道網が一通り完成した明治時代中期以降に夜行列車が運行されるようになった『これでいいのか 夜行列車』p.20。当時の長距離列車は昼夜を問わず走らないと目的地に到着しないものであり、必然的に夜行列車となった。当初は座席車のみによる運転であったが、1900年（明治33年）に山陽鉄道（現在の山陽本線などを運営）が日本で初めて寝台車の提供を行った『日本の国鉄』p.41。
大私鉄によって形成されていた鉄道網は1907年（明治40年）にほとんどが国有化され『日本の鉄道史セミナー』p.69、帝国鉄道庁（のち鉄道院 → 鉄道省 → 運輸通信省鉄道総局 → 運輸省）により様々な夜行列車が運行されるようになった。国有化され官営鉄道となって以降は、軌道や車両の改良により速度の向上が図られた。1912年（明治45/大正元年）から運行された東京駅 - 下関駅間の特別急行列車（列車番号は下りが1列車、上りが2列車）は新橋駅を8時30分に出発し、大阪駅には20時33分、山陽本線内は夜行で走って終点の下関駅には翌朝の9時38分に到着しており、所要時間は25時間8分であった。1・2列車は日本を代表する列車として設定されており、編成は一等展望車1両、一等寝台車1両、二等座席車2両、二等寝台車1両、食堂車と荷物車の7両編成であった。この列車は1930年（昭和5年）に「富士」と命名されさらにスピードアップ、東京駅を13時ちょうどに発車し下関駅到着が翌朝の8時50分、所要時間は19時間50分となったが、やはり山陽本線区間は夜行であった『国鉄・JR名列車ハンドブック』pp.19-20。
第二次世界大戦前の官営鉄道全盛期であった1937年（昭和12年）には、東京駅 - 下関駅間の「富士」と、三等座席車主体の「櫻」の2本の特急なお、同時期の特急はこの2本と東京駅 - 大阪駅間の「燕」と「鷗」のみでいずれも昼行であった。他に、当時は外地であった朝鮮総督府鉄道（鮮鉄）釜山駅 - 京城駅（現：ソウル駅）間運行の「あかつき」と、日本の資本・影響下にあった南満洲鉄道（満鉄）の「あじあ」（大連駅 - 哈爾浜駅間）が「特別急行列車」という扱いであった（特別急行列車も参照のこと）。のほかに4本の急行が設定されており、うち2往復が東海道本線内を、他の2往復が山陽本線内を夜行運転した。また、東京と関西の間には4本の急行が設定されており、そのうち東京駅 - 神戸駅間の夜行急行「17,18列車」は一・二等専用で別名「名士列車」と呼ばれていた『国鉄の戦後が分かる本』上巻 p.36。これら第二次世界大戦前の優等列車は太平洋戦争（大東亜戦争）が激化した1944年（昭和19年）に全廃され、同時に寝台車も運用されなくなった。
終戦後は、1945年（昭和20年）11月20日に東京駅 - 大阪駅間に夜行急行が復活し、1948年（昭和23年）には寝台車の供用が再開された『寝台急行「銀河」物語』p.17。その後、官営鉄道は1949年（昭和24年）に新たに設立された公共企業体である国鉄に引き継がれ、国鉄により日本の復興とともに夜行列車は順次増強されていった。昭和30年代に国鉄旅客局が行った「旅行に昼行と夜行のどちらを選ぶか」という調査では、乗車時間が7時間半から9時間であれば昼行と夜行の利用が拮抗しているが、9時間以上であれば夜行が好まれるという結果が得られた。当時の東海道本線に当てはめれば、東京駅 - 大阪駅間は特急列車を利用しない限り夜行列車のほうが好まれる状況であった『寝台急行「銀河」物語』p.31。また1957年（昭和32年）の国鉄第一次5カ年計画において、「特急列車のうち、昼行は電車またはディーゼルカーを充当し、夜行列車には寝台客車とする」ことが決定した。1956年（昭和31年）に急行と同じ形式の座席車と寝台車を寄せ集めて誕生した夜行特急「あさかぜ」の車両は、1958年（昭和33年）からこの方針に従って製作された20系客車に変更された『戦後日本の鉄道車両』p.94。
当時は単線非電化の路線が多く、列車の速度も低かった。例えば1956年（昭和31年）11月19日のダイヤ改正では、鹿児島駅行きの急行「さつま」が東京駅を21時45分に出発し、鹿児島駅に到着するのは翌々日の朝5時46分、運転時間は約32時間であった『国鉄・JR名列車ハンドブック』p.71。
これら九州行きの列車も含めて東海道本線には夜行列車が増加し、高度経済成長期の真っただ中かつ東海道新幹線が開通する直前の1963年（昭和38年）から1964年（昭和39年）9月にかけてが夜行列車の本数のピークとなった。1964年（昭和39年）9月当時、東京駅を発車する東海道本線の夜行列車の本数は、当時の時刻表によれば以下の通りであった『寝台急行「銀河」物語』pp.81-83。 九州行の20系客車を使用した特急列車 : 4往復 「寝台列車」と表示された客車急行 : 大阪・神戸駅行7往復、広島駅行1往復 夜行の電車急行 : 大阪・姫路駅行3往復、大垣駅行1往復 座席車を主体とする客車急行 : 九州・山陽・山陰・北陸等6往復 普通列車 : 大阪駅行1往復 当時、東京駅では19時50分から22時10分にかけて、10分毎に夜行列車が発車した。このほか、東海道本線を昼間走り山陽本線を夜行で行く九州行の客車急行も4往復あった『国鉄の戦後が分かる本』上巻 pp.160-161。
新幹線開業後 京阪神を目的地とした夜行列車は東海道新幹線の営業開始とともに急激に減少し、昼行の直通列車が終了正確には、九州直通の急行列車であった「霧島」や「高千穂」が東海道本線内は昼行運転、山陽本線内では夜行運転となった。した1968年（昭和43年）10月のダイヤ改正「ヨンサントオ」では、寝台列車の急行2往復と普通1往復にまで減少した『寝台急行「銀河」物語』p.45。1972年3月に山陽新幹線が岡山駅まで開業したが、岡山以西の山陽本線を走る夜行列車は特急列車が定期列車19往復と季節列車1往復、急行列車が定期列車11往復と季節列車6往復という大勢力であった「国鉄の戦後が分かる本」下巻 P44。1975年（昭和50年）3月10日のダイヤ改正（ゴーマルサン）の山陽新幹線博多延伸開業時には岡山以西で夜行特急列車が定期列車14往復と季節列車1往復、急行列車が定期列車のみ4往復に減少している『国鉄の戦後が分かる本』下巻 p.89。
1960年代後半（昭和40年代）以降は電化や線路・車両の改良などによる更なる高速化が図られ、長距離列車の運転時間は長くとも28時間程度に抑えられ、車中1泊の行程で運行する列車のみとなった。まだこの頃までは移動手段としては鉄道利用が一般的であったため、ブルートレインと呼ばれた寝台列車は高い人気を誇った。
しかし、1970年代後半（昭和50年代）から1980年代にかけて、山陽新幹線博多延伸・東北新幹線・上越新幹線の開業による新幹線網の拡充で移動時間が更に短縮された。さらに、国内航空路線の拡充と航空運賃の自由化により以前と比べ飛行機が利用しやすくなったこと、高速道路網の整備により鉄道より安価な夜行バスが台頭したことなどもあり、夜行列車の利用は低迷するようになった。特に寝台列車は別途で寝台料金が必要なため新幹線より割高な料金設定や、相次ぐ国鉄の運賃値上げ、車両の老朽化・陳腐化もあって次第に敬遠されるようになり、乗車率の伸び悩みで削減や臨時列車化、または廃止が相次いだBusiness Media 誠：杉山淳一の時事日想：夜行列車はなぜ誕生し、衰退したのか（2013年11月8日）。1979年には当時の運輸大臣であった森山欽司が「国鉄の財政改善のため、非効率な夜行列車は廃止すべき」と表明し、議論を呼んだことがあった参考：参議院運輸委員会会議録（1979年6月5日）。
なお、1980年代前半までは主要幹線で夜行普通列車も多く運転されており、寝台車が連結された列車もあり、並行する優等列車を補完する役目を担っていた。
夜行の急行列車・普通列車の重要な使命としては、新聞（特に朝刊）輸送があった。通信手段が未発達だった当時、都心で印刷された新聞は荷物車により輸送され、未明の各駅に降ろされ、直ちに新聞販売店を経て、各家庭に配達された『鉄道ジャーナル』（編集・発行 鉄道ジャーナル社）、1980年7月号（通巻161号）、24 - 28頁。また郵便物についても郵便車による輸送が行われた。現在この輸送は、トラック・航空貨物に取って代わられた。
このほか、中学校・高校の修学旅行においても夜行列車や寝台列車が利用されるケースが多々あった事例として、東京駅 - 明石駅駅間を往復する「きぼう」が挙げられる。「修学旅行列車」も参照。が、新幹線の延伸・高速化、昼行特急列車の利用に伴う昼間移動への移行、観光バスによるバス移動、1990年代以降に公立学校においても航空機の利用が解禁されたことによる空路利用への転移、海外や沖縄への修学旅行の増加などの理由により、同年代以降は、修学旅行に夜行列車・寝台列車が利用されることはよほどの行程上の事情がない限りなくなっている。同様に、阪神甲子園球場で開催される高校野球全国大会出場校の応援団もかつては「甲子園臨」と呼ばれた専用列車を利用して夜通し駆けつけるケースが多かったが、これらも現状は貸切バスや航空機、新幹線などでの移動に切り替えられている。
国鉄分割民営化と衰退 1987年に国鉄が分割民営化され、1990年代から2000年代にかけて、夜行列車は相次いで廃止、急速に淘汰されていった。その一方で、「北斗星」や「カシオペア」「トワイライトエクスプレス」といった本州と北海道とを結んだ寝台列車のように食堂車でのフルコースディナー等のサービス提供を行う列車や、東京駅 - 四国・山陰を結ぶ「サンライズ瀬戸」「サンライズ出雲」のように個室寝台を基本として快適性を高めた列車など、乗車自体を鉄道旅行の目的とする列車も人気を博した。
整備新幹線開業の影響 地方への整備新幹線の開業により、並行在来線はJRから経営が切り離されて第三セクター鉄道会社へ移管されると共に、夜行列車の廃止が相次いだ。
「能登」は、長野新幹線開業時に並行在来線が横川駅 - 軽井沢駅間で第三セクターに移管することなく廃線されたため、上越線経由に変更された。 西鹿児島駅まで運行されていた「なは」は、九州新幹線開業に際して転換された肥薩おれんじ鉄道に乗り入れを行わず、熊本駅までに運行短縮し、さらにその4年後には廃止された。 上野駅と青森駅を東北本線経由で結んでいた「はくつる」は、東北新幹線の盛岡駅 - 八戸駅間開業時の2002年11月に廃止された。ただし、この際に経営分離されたIGRいわて銀河鉄道と青い森鉄道には「北斗星」*「カシオペア」が夜行（準）定期列車としてその後もそれぞれ2015年、2016年まで乗り入れていた「カシオペア」車両を使用して2016年6月より運行されている団体臨時列車は、この両線と道南いさりび鉄道（旧・江差線）を経由する。。「トワイライトエクスプレス」は北陸新幹線開業に際して移管される第三セクターに乗り入れることなく廃止された。
後述の「ななつ星 in 九州」も、2013年10月の運転開始当初、第三セクターの肥薩おれんじ鉄道線を避けて肥薩線経由での運行となった2016年4月からは肥薩おれんじ鉄道と合意の上で同線経由での運転を実施している。。
豪華寝台列車の登場と一般夜行列車の減少 2010年代に入ると、JR九州が2013年10月15日から、九州を周遊する豪華寝台列車「ななつ星 in 九州」豪華寝台列車：「ななつ星in九州」車両製作場を開設の運行を開始した。この「ななつ星in九州」は、九州を周遊する観光旅行を豪華寝台列車による移動で楽しむというコンセプトに基づく旅行商品（パッケージツアー）のため時刻表への記載はなく、費用も「運賃 + 料金」ではなく全てがパッケージされた「旅行代金」である。この豪華寝台列車の登場と成功は大きなインパクトを与え、後にJR東日本やJR西日本も同コンセプトの列車・車両（JR東日本は「TRAIN SUITE 四季島」、JR西日本は「TWILIGHT EXPRESS 瑞風」）を開発、製造することになり、それぞれ2017年より運行を開始した。3列車とも費用は高額ながら人気は高く、希望者多数のため抽選となっている。
一方定期夜行列車では、「サンライズ瀬戸・出雲」以外の列車は車両の老朽化、北海道新幹線開業後は青函トンネル利用時の専用複電圧機関車を新造しないこと、更には整備新幹線開業による並行在来線の移管によって運転業務が煩雑になることなどを理由に、臨時列車化ないしは廃止されることになったブルートレイン：廃止へ…JR3社、北海道新幹線開業で（2013年11月8日時点のアーカイブ） - 『毎日新聞』2013年11月7日。結局、「トワイライトエクスプレス」は2015年（平成27年）3月12日の札幌駅発をもって廃止、「北斗星」は臨時列車化のち青函トンネルの新幹線対応工事に伴い、同年8月22日の札幌駅発をもって廃止、「カシオペア」も2016年（平成28年）3月20日の札幌駅発をもって廃止となった。
座席車を主体とする急行列車、快速列車においても2016年3月に「はまなす」が廃止されたことで定期列車としては全て廃止されたため、JRグループにおいて寝台料金不要で乗車できる定期運行の夜行列車はサンライズ瀬戸・出雲のノビノビ座席のみとなっている。運転頻度の高い臨時列車においても最後まで残っていた「ムーンライトながら」が2021年1月に廃止が発表された新型コロナウイルス感染症の流行により2020年春季を最終運行として運行休止となり、運行再開することなく2021年1月に廃止が発表された。。
大手私鉄での夜行列車 2018年現在では東武鉄道と西武鉄道が臨時列車に限り夜行列車を運転している。いずれも首都圏外縁部周辺の観光地へ向けて東京都区部や横浜市内を前夜に出発し、翌日未明に星空を観賞したり、早朝から観光したりできるように設定されている。行き先は、西武鉄道が秩父地方西武鉄道など、「夜行列車で行く 秩父絶景ツアー」の募集を開始 日本経済新聞プレスリリース転載サイト（2018年2月19日）2018年12月23日閲覧、東武鉄道は日光や尾瀬、会津地方である（発着駅は相互直通運転の他社区間を含む。詳細は東武鉄道夜行列車を参照）。
西武鉄道では1973年までは夜行列車「こぶし」がレッドアロー車両を使用して休前日に限り定期運転されていた。その後、西武鉄道の夜行列車は臨時列車に限り2015年8月に再開した西武、夜行列車を運行 私鉄では特にレア - 乗りものニュース 2015年6月16日発信（2015年12月12日閲覧）。
なお、東武・西武ともに、夜通し運転せず未明に到着するため、厳密には夜行列車の範疇ではないが、両社の公式ホームページで発表される臨時列車の案内や系列旅行会社による募集広告では「夜行列車」と称している。
そのほか、他の鉄道事業者に乗り入れての夜行運転では、南海電気鉄道南海本線と国鉄紀勢本線を直通する難波駅 - 新宮駅間の客車夜行列車（南海本線内は電車が牽引し、料金不要の特急扱い。和歌山駅以南は天王寺駅発着の夜行普通列車と併結列車自体は新宮駅からさらに運行されて名古屋駅発着（1959年の紀勢本線全通後）であったが、南海難波駅発着の客車（1両のみ製造された南海サハ4801形客車又は国鉄の客車）は新宮駅で増解結していた。紀勢本線#夜行普通列車も参照。）が、1951年4月6日から1972年3月14日まで運行されていた。
近畿日本鉄道では2025年、大阪・関西万博入場客輸送を目的として「ひのとり」（大阪難波 - 近鉄名古屋）の夜行臨時運行を、2025年4月12日、6月14日、7月19日、9月13日、10月11日の5日間限定で運転したが、大阪・関西万博の閉幕後も不定期で運転されている「5月3日運行 近鉄，特急「ひのとり」を夜行列車として運行する「ミッドナイトひのとり」を実施」-『railf.jp（鉄道イベント）』、交友社（2026年3月14日） - 近畿日本鉄道（2026年5月15日）「7月19日／8月15日出発 近鉄，特急「ひのとり」を夜行列車として運行する「ミッドナイトひのとり」を実施」-『railf.jp（鉄道イベント）』、交友社（2026年5月15日）。
運行中の列車 2026年時点、日本で運行されている夜行列車は下表のとおりである。太字は毎日運行される定期列車。 +日本における運行中の夜行列車 列車名など列車種別運行区間運行事業者設備備考サンライズ瀬戸[特]東京 - 岡山 - 高松かつては多客期に高松 - 松山間を延長運転していたことがあった。現在は、東京発下りの週末の多客期に琴平まで延長運転されている。JR東日本JR東海JR西日本JR四国[寝][簡]東京駅 - 岡山駅間は「サンライズ出雲」と併結運転。サンライズ出雲[特]東京 - 岡山 - 出雲市JR東日本JR東海JR西日本[寝][簡]東京駅 - 岡山駅間は「サンライズ瀬戸」と併結運転。多客期には東京 - 出雲市間を単独運転の91・92号が増発される。WEST EXPRESS 銀河[特][臨]京都 - 出雲市・新宮・下関時期により行先が異なる。JR西日本[簡][座]運行開始当初は旅行商品に限り販売。2023年（令和5年）2月13日以降は、切符（特急券・グリーン券）単体の購入も可能但し、通常の列車とは異なり乗降駅の制限あり（詳細は当該記事参照）。。谷川岳山開き[特][臨]上野 - 土合JR東日本[座]下りのみ（折返し上り同列車は昼行）。夏季に年間1回程度運行。2021年までは快速列車。アルプス[特][臨]新宿 - 白馬JR東日本[座]下りのみ。各シーズンに数日運行。2018年まで快速ムーンライト信州として運転していた列車。2024年7月より臨時特急列車として運行開始。諏訪湖花火大会号[特][臨]新宿 - 上諏訪JR東日本[座]上りのみ。夏季に年間2回程度運行。2018年まで快速ムーンライト信州、2019年に快速諏訪湖花火大会号として運転していた列車。2020年から2022年まで3シーズン運休ののち、2023年8月15日に特急列車に格上げの上復活する。全国花火競技大会（大曲の花火）関連[特][普][臨]大曲 - 大館・新庄・盛岡などJR東日本[座]特急「こまち」（東北新幹線への乗り入れは行わない）、普通列車「花火」（秋田・大館方面）・「スターマイン」（新庄方面）・「ナイアガラ」（盛岡方面）を運行「大曲の花火」増発列車のお知らせ - JR東日本秋田支社（2023年10月12日閲覧）。熊野大花火大会関連[特][快][普][臨]熊野市 - 名古屋などJR東海伊勢鉄道[座]特急「熊野大花火」、快速列車、普通列車を運行。特急と一部の快速列車は名古屋駅まで運行される【8月29日(火)】熊野大花火大会開催に伴う臨時列車の運転について - 熊野市観光協会（2023年10月12日閲覧）。TRAIN SUITE 四季島[団][臨]上野駅で乗降のみJR東日本JR北海道IGRいわて銀河鉄道青い森鉄道道南いさりび鉄道しなの鉄道えちごトキめき鉄道[寝]周遊型豪華寝台列車（クルーズトレイン）※TWILIGHT EXPRESS 瑞風[団][臨]京都駅・大阪駅・下関駅発着JR西日本[寝]周遊型豪華寝台列車（クルーズトレイン）※ななつ星 in 九州[団][臨]博多駅で乗降のみJR九州肥薩おれんじ鉄道[寝]周遊型豪華寝台列車（クルーズトレイン）※尾瀬夜行[特][団][臨]浅草 - 会津高原尾瀬口東武鉄道野岩鉄道[座]ツアー形式の臨時列車として原則夏季の週末に運行。スノーパル[特][団][臨]浅草 - 会津高原尾瀬口東武鉄道野岩鉄道[座]ツアー形式の臨時列車として原則冬季の週末に運行。日光紅葉夜行[特][団][臨]浅草 - 東武日光東武鉄道[座]ツアー形式の臨時列車として原則秋季の週末に運行。秩父夜行[特][団][臨]池袋元町・中華街、新木場 始発で運転することがある。 - 西武秩父西武鉄道東京地下鉄東急電鉄横浜高速鉄道[座]ツアー形式の臨時列車として年間数回程度運行走行77kmの夜行列車 その目的は 西武 - 乗りものニュース 2015年8月26日発信（2016年2月11日閲覧）。夜行急行 三峰号[急][団][臨]熊谷 - 三峰口秩父鉄道[座]ツアー形式の臨時列車として年間1 - 数回程度運行秩父鉄道&日本旅行共同企画「重連電機・12系客車 夜行急行『三峰51号』熊谷行の旅」 - 秩父鉄道（2021年8月25日閲覧）。表中各記号は[特]：特急、[急]：急行、[快]：快速、[普]：普通、[臨]：臨時列車、[団]：団体専用列車、[寝]：寝台車、[簡]：簡易寝台（ノビノビ座席）料金制度上は座席車扱いながら、横臥可能な設備が供される。、[座]：座席車 更に2025年6月をもって引退するカシオペアに代わって、JR東日本E657系電車を改造した新夜行列車「ルナ・アズール（スペイン語で「青い月」）」の運行を開始する予定。春季から秋季にかけては品川駅 - 青森駅間を夜行列車として運行し、冬季は品川駅 - 長野原草津口駅間を昼行列車として運行する予定。乗車定員は120人程度となる。
※「TRAIN SUITE 四季島」「TWILIGHT EXPRESS 瑞風」「ななつ星 in 九州」はツアー形式の周回列車であり、移動手段としての従来の夜行列車とは性格が異なる。
廃止された列車の一覧
五十音順。列車愛称のないもの・イベント列車に類するものは除く。一覧中各記号は［特］：特急、［急］：急行、［快］：快速、［普］：普通、［臨］：臨時列車、［団］：団体専用列車。 廃止された列車 あかつき ［急］・［特］ 安芸 ［急］・［特］ あさかぜ ［特] 阿蘇 ［急］ 天の川 ［急］ アルプス ［急］ アルペン ［急］［臨］ 出雲 ［特］ いそつり ［快］［臨］ いよ ［急］ うわじま ［急］ 雲仙 ［急］ 越前 ［急］ エルム ［特］［臨］ おいらせ ［急］ おが ［急］ オホーツク ［特］ かいもん ［急］ 加賀 ［急］ カシオペア ［特］［臨］ カシオペアクルーズ ［団］［臨］ カシオペア紀行［団］［臨］ からまつ ［普］ 紀伊 ［急］・［特］ 紀州 ［急］ きそ ［急］ きたぐに ［急］ きのくに ［急］→［快］［臨］（JR化後） きりしま ［急］ 銀河 ［急］ 金星 ［急］・［特］ くにさき ［急］ 月光 ［特］ 玄海 ［急］ こぶし ［特］［臨］ 西海 ［急］ さくら ［特］ 桜島 ［急］・［特］ 山陰 ［普］ さんべ ［急］ シュプール号 ［急］ 新星 ［急］ 彗星 ［急］・［特］ すずらん ［急］ スターライト ［快］［臨］ 大雪 ［急］ だいせん ［急］ 立山 ［急］ ちどり ［急］ 鳥海 ［急］・［特］ ちくま ［急］ 津軽 ［急］ つるぎ ［急］・［特］ 出羽 ［急］・［特］ ドリームつばめ ［特］ ドリームにちりん ［特］ トワイライトエクスプレス ［特］［臨］ 特別な「トワイライトエクスプレス」 ［団］［臨］ 十和田 ［急］ ながさき ［普］ なは ［特］ 南紀 ［普］ 日南 ［急］ 日光山岳夜行 ［急］［臨］ のりくら ［急］ はくつる ［特］ 八甲田 ［急］ はまなす ［急］ はやたま ［普］ はやぶさ ［特］ 富士 ［特］ 北星 ［急］・［特］ 北斗星 ［特］ 北陸 ［特］ まりも ［急］ みずほ ［特］ ミッドナイト ［快］ 妙高 ［急］ 明星 ［急］・［特］ ムーンライト号 (ムーンライトながら)- 東日本旅客鉄道プレスリリース、2021年1月22日- 東海旅客鉄道ニュースリリース、2021年1月22日［快］［臨］ ゆうづる ［特］ 利尻 ［急］・［特］ 鷲羽 ［急］ 廃止発表はされていないが、現在運行されていない夜行列車。 あけぼの ［特］［臨］（上野 - 青森：羽越本線・奥羽本線経由） - 2014年3月14日をもって定期運転終了鉄道コム。2015年1月4日を最後に臨時列車としての運行も終了。 おわら ［特］［臨］ サンライズゆめ ［特］［臨］ 日本海 ［特］［臨］ - 2013年春季以降、運転日設定がなく、JR東日本は存廃検討中としていたが、2013年夏季以降設定されていない。運行区間のうち、直江津駅 - 金沢駅間は北陸新幹線開業に伴い2015年3月14日にJRから第三セクター鉄道に移管されている。 能登 ［急］［臨］ - JR東日本の公式見解では運行中止扱いとなっているたかが臨時されど臨時 - 『中日新聞』 2012年3月17日。運行区間のうち、直江津駅 - 金沢駅間は2015年3月14日にJRから第三セクター鉄道に移管されている。 ムーンライトえちご ［快］［臨］ - 2014年5月23日に発表された夏の増発列車に記載されず - 東日本旅客鉄道プレスリリース、2014年5月23日、2014年夏の運行はなく「ムーンライトえちご」今夏は運行なし - JR東日本新潟支社、夏の臨時列車 - マイナビニュース、2014年5月26日、以降の運行の予定もない。 ムーンライト信州 ［快］［臨］ - 2019年5月17日に発表された夏の増発列車の案内で90号のスジが「諏訪湖花火大会号」に名称変更されたため廃止が確認された - 東日本旅客鉄道プレスリリース、2019年5月17日。 ムーンライト仙台・ムーンライト東京 ［快］［臨］ ムーンライト松島・横浜 ［快］［臨］ 舞浜ドリーム号 ［団］［臨］ - ツアー形式の臨時列車として年間数回程度運行。但し、2017年7月21日弘前発、折り返し同7月23日着を最後に運転は行われていない。 スターライト舞浜号 ［団］［臨］ - ツアー形式の臨時列車として年間数回程度運行。但し、2019年5月24日新潟発、折り返し同5月26日着を最後に運転は行われていない。 ムーンライト九州 ［快］［臨］さよなら青春の夜行快速 関西発着の「ムーンライト」 - 『朝日新聞』 2009年6月22日 ムーンライト高知 ［快］［臨］ ムーンライト松山 ［快］［臨］ ムーンライト山陽 ［快］［臨］ ムーンライト八重垣 ［快］［臨］
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