日本の港湾一覧（にほんのこうわんいちらん）は、日本の港湾の一覧である。
2023年（令和5年）4月1日現在、日本国内には993の港湾がある（国土交通省港湾局）。港湾法の定めによる港湾の種別は以下のとおり港湾種別。 国際戦略港湾 - 5港 国際拠点港湾 - 18港 重要港湾 - 102港 地方港湾 - 807港 56条港湾 - 61港
北海道 国際拠点港湾 室蘭港（室蘭市） 苫小牧港（苫小牧市・勇払郡厚真町）
重要港湾 石狩湾新港（小樽市・石狩市） 稚内港（稚内市） 函館港（函館市） 小樽港（小樽市） 釧路港（釧路市） 留萌港（留萌市） 十勝港（広尾郡広尾町） 紋別港（紋別市） 網走港（網走市） 根室港（根室市）
地方港湾 石狩港（石狩市） 椴法華港（函館市） 森港（茅部郡森町） 松前港（松前郡松前町） 江差港（檜山郡江差町） 瀬棚港（久遠郡せたな町） 奥尻港（奥尻郡奥尻町） 余市港（余市郡余市町） 岩内港（岩内郡岩内町） 羽幌港（苫前郡羽幌町） 焼尻港（苫前郡羽幌町） 天売港（苫前郡羽幌町） 増毛港（増毛郡増毛町） 天塩港（天塩郡天塩町） 宗谷港（稚内市） 香深港（礼文郡礼文町） 沓形港（利尻郡利尻町） 鴛泊港（利尻郡利尻富士町） 枝幸港（枝幸郡枝幸町） 白老港（白老郡白老町） 浦河港（浦河郡浦河町） えりも港（幌泉郡えりも町） 霧多布港（厚岸郡浜中町）
56条港湾 昆布刈石港（十勝郡浦幌町） 堀株港（古宇郡泊村） 西恵山港（函館市） 浜猿払港（宗谷郡猿払村） 忠類港（標津郡標津町） 崎無異港（標津郡標津町）
東北 青森県 重要港湾 八戸港（八戸市） 青森港（青森市） むつ小川原港（上北郡六ヶ所村） 地方港湾 大湊港（むつ市） 川内港（むつ市） 大間港（下北郡大間町） 尻屋岬港（下北郡東通村） 仏ヶ浦港（下北郡佐井村） 野辺地港（上北郡野辺地町） 小湊港（東津軽郡平内町） 子ノ口港（十和田市） 休屋港（十和田市） 深浦港（西津軽郡深浦町） 津軽港（つがる市） 56条港湾 関根浜港（むつ市）
岩手県 重要港湾 久慈港（久慈市） 宮古港（宮古市） 大船渡港（大船渡市） 釜石港（釜石市） 地方港湾 八木港（九戸郡洋野町） 小本港（下閉伊郡岩泉町）
宮城県 国際拠点港湾 仙台塩釜港（仙台市・塩竈市・東松島市・石巻市） 地方港湾 気仙沼港（気仙沼市） 御崎港（気仙沼市） 雄勝港（石巻市） 荻浜港（石巻市） 金華山港（石巻市） 表浜港（石巻市） 女川港（牡鹿郡女川町）
秋田県 重要港湾 秋田港（秋田市） 船川港（男鹿市） 能代港（能代市） 地方港湾 本荘港（由利本荘市） 戸賀港（男鹿市）
山形県 重要港湾 酒田港（酒田市） 地方港湾 鼠ヶ関港（鶴岡市） 加茂港（鶴岡市）
福島県 重要港湾 小名浜港（いわき市） 相馬港（相馬市） 地方港湾 江名港（いわき市） 久之浜港（いわき市） 中之作港（いわき市） 翁島港（耶麻郡猪苗代町） 湖南港（郡山市）
関東 茨城県 重要港湾 茨城港（日立市・那珂郡東海村・ひたちなか市・東茨城郡大洗町） 鹿島港（鹿嶋市・神栖市） 地方港湾 潮来港（潮来市） 土浦港（土浦市） 河原子港（日立市） 川尻港（日立市） 軽野港（神栖市）
千葉県 国際拠点港湾 千葉港（千葉市・船橋市・市川市・習志野市・市原市・袖ケ浦市） 重要港湾 木更津港（木更津市・君津市・富津市） 地方港湾 館山港（館山市） 興津港（勝浦市） 名洗港（銚子市） 上総湊港（富津市） 浜金谷港（富津市）
東京都 国際戦略港湾 東京港（江東区・中央区・港区・大田区） 地方港湾 元町港（大島町） 岡田港（大島町） 波浮港（大島町） 利島港（利島村） 新島港（新島村） 式根島港（新島村） 神津島港（神津島村） 大久保港（三宅村） 三池港（三宅村） 御蔵島港（御蔵島村） 神湊港（八丈町） 八重根港（八丈町） 青ヶ島港（青ヶ島村） 大千代港（青ヶ島村） 二見港（小笠原村） 沖港（小笠原村）
神奈川県 国際戦略港湾 横浜港（横浜市） 川崎港（川崎市） 重要港湾 横須賀港（横須賀市） 地方港湾 大磯港（中郡大磯町） 真鶴港（足柄下郡真鶴町） 湘南港（藤沢市） 葉山港（三浦郡葉山町）
中部 新潟県 国際拠点港湾 新潟港（新潟市・北蒲原郡聖籠町） 重要港湾 両津港（佐渡市） 直江津港（上越市） 小木港（佐渡市） 地方港湾 柏崎港（柏崎市） 寺泊港（長岡市） 岩船港（村上市） 二見港（佐渡市） 赤泊港（佐渡市） 姫川港（糸魚川市）
富山県 国際拠点港湾 伏木富山港（高岡市・富山市・射水市） 地方港湾 魚津港（魚津市）
石川県 重要港湾 金沢港（金沢市） 七尾港（七尾市） 地方港湾 穴水港（鳳珠郡穴水町） 宇出津港（鳳珠郡能登町） 小木港（鳳珠郡能登町） 飯田港（珠洲市） 輪島港（輪島市） 福浦港（羽咋郡志賀町） 滝港（羽咋市） 塩屋港（加賀市） 和倉港（七尾市） 半ノ浦港（七尾市）
福井県 重要港湾 敦賀港（敦賀市） 地方港湾 福井港（坂井市・福井市） 鷹巣港（福井市） 和田港（大飯郡高浜町） 内浦港（大飯郡高浜町）
静岡県 国際拠点港湾 清水港（静岡市） 重要港湾 田子の浦港（富士市） 御前崎港（御前崎市・牧之原市） 地方港湾 熱海港（熱海市） 伊東港（伊東市） 下田港（下田市） 松崎港（賀茂郡松崎町） 宇久須港（賀茂郡西伊豆町） 手石港（賀茂郡南伊豆町） 土肥港（伊豆市） 沼津港（沼津市） 相良港（牧之原市） 榛原港（牧之原市） 浜名港（浜松市） 大井川港（焼津市）
愛知県 国際拠点港湾 名古屋港（名古屋市・東海市・知多市・弥富市・海部郡飛島村） 重要港湾 衣浦港（半田市・碧南市・刈谷市・西尾市・高浜市・知多郡東浦町・知多郡美浜町・知多郡武豊町） 三河港（豊橋市・田原市・蒲郡市・豊川市） 地方港湾 常滑港（常滑市） 吉田港（西尾市） 東幡豆港（西尾市） 倉舞港（蒲郡市） 河和港（知多郡美浜町） 冨具崎港（知多郡美浜町） 師崎港（知多郡南知多町） 内海港（知多郡南知多町） 伊良湖港（田原市） 泉港（田原市） 馬草港（田原市） 福江港（田原市）
関西 三重県 国際拠点港湾 四日市港（四日市市・三重郡川越町） 重要港湾 津松阪港（津市・松阪市） 尾鷲港（尾鷲市） 地方港湾 桑名港（桑名市） 白子港（鈴鹿市） 千代崎港（鈴鹿市） 宇治山田港（伊勢市） 鳥羽港（鳥羽市） 的矢港（志摩市・鳥羽市） 賢島港（志摩市） 浜島港（志摩市） 五ヶ所港（度会郡南伊勢町） 吉津港（度会郡南伊勢町） 紀伊長島港（北牟婁郡紀北町） 引本港（北牟婁郡紀北町） 賀田港（尾鷲市） 三木里港（尾鷲市） 木本港（熊野市） 二木島港（熊野市） 鵜殿港（南牟婁郡紀宝町）
滋賀県 地方港湾 大津港（大津市） 彦根港（彦根市） 長浜港（長浜市） 竹生島港（長浜市）
京都府 重要港湾 舞鶴港（舞鶴市） 地方港湾 久美浜港（京丹後市） 宮津港（宮津市） 伏見港（京都市）
大阪府 国際戦略港湾 大阪港（大阪市） 国際拠点港湾 堺泉北港（堺市・高石市・泉大津市） 重要港湾 阪南港（泉北郡忠岡町・岸和田市・貝塚市） 地方港湾 二色港（貝塚市） 泉佐野港（泉佐野市） 泉州港（泉南郡田尻町・泉佐野市・泉南市） 尾崎港（阪南市） 淡輪港（泉南郡岬町） 深日港（泉南郡岬町）
兵庫県 国際戦略港湾 神戸港（神戸市） 国際拠点港湾 姫路港（姫路市） 重要港湾 尼崎西宮芦屋港（尼崎市・西宮市・芦屋市） 東播磨港（明石市・加古郡播磨町・加古川市・高砂市） 地方港湾 明石港（明石市） 江井ヶ島港（明石市） 岩屋港（淡路市） 郡家港（淡路市） 浦港（淡路市） 江井港（淡路市） 津名港（淡路市） 山田港（淡路市） 淡路交流の翼港（淡路市） 室津港（淡路市） 洲本港（洲本市） 由良港（洲本市） 都志港（洲本市） 古茂江港（洲本市） 阿万港（南あわじ市） 福良港（南あわじ市） 湊港（南あわじ市） 津井港（南あわじ市） 家島港（姫路市） 相生港（相生市） 赤穂港（赤穂市） 古池港（赤穂市） 坂越港（赤穂市） 津居山港（豊岡市） 竹野港（豊岡市） 柴山港（美方郡香美町）
和歌山県 国際拠点港湾 和歌山下津港（和歌山市・海南市・有田市） 重要港湾 日高港（御坊市・美浜町） 地方港湾 大川港（和歌山市） 加太港（和歌山市） 湯浅広港（有田郡湯浅町・広川町） 由良港（日高郡由良町） 文里港（田辺市） 日置港（西牟婁郡白浜町） 袋港（東牟婁郡串本町） 古座港（東牟婁郡串本町） 大島港（東牟婁郡串本町） 勝浦港（東牟婁郡那智勝浦町） 浦神港（東牟婁郡那智勝浦町） 宇久井港（東牟婁郡那智勝浦町） 新宮港（新宮市）
中国 鳥取県 重要港湾 鳥取港（鳥取市） 境港（境港市・島根県松江市） 地方港湾 田後港（岩美郡岩美町） 米子港（米子市） 赤碕港（東伯郡琴浦町） 逢坂港（西伯郡大山町） 56条港湾 小浜港（鳥取市） 石脇港（東伯郡湯梨浜町） 豊成港（西伯郡大山町） 中浜港（境港市）
島根県 重要港湾 浜田港（浜田市） 三隅港（浜田市） 西郷港（隠岐郡隠岐の島町） 地方港湾 松江港（松江市） 海崎港（松江市） 才港（松江市） 軽尾港（松江市） 諸喰港（松江市） 法田港（松江市） 七類港（松江市） 惣津港（松江市） 笹子港（松江市） 菅浦港（松江市） 千酌港（松江市） 笠浦港（松江市） 佐波港（松江市） 秋鹿北港（松江市） 江島港（松江市） 遅江港（松江市） 波入港（松江市） 入江港（松江市） 意東港（松江市） 揖屋港（松江市） 安来港（安来市） 伊野灘港（出雲市） 河下港（出雲市） 黒田港（出雲市） 中山港（出雲市） 二俣港（出雲市） 小田東港（出雲市） 田儀港（出雲市） 島津屋港（大田市） 山谷港（大田市） 灘山港（大田市） 久手港（大田市） 魚津港（大田市） 宅野港（大田市） 網屋港（大田市） 舟津港（大田市） 温泉津港（大田市） 吉浦港（大田市） 江津港（江津市） 生湯港（浜田市） 吉浦港（浜田市） 高島港（益田市） 遠田港（益田市） 益田港（益田市） 持石港（益田市） 喜阿弥港（益田市） 重栖港（隠岐郡隠岐の島町） 代港（隠岐郡隠岐の島町） 伊後港（隠岐郡隠岐の島町） 西村港（隠岐郡隠岐の島町） 飯美港（隠岐郡隠岐の島町） 卯敷港（隠岐郡隠岐の島町） 釜港（隠岐郡隠岐の島町） 汐浜港（隠岐郡隠岐の島町） 小津久港（隠岐郡隠岐の島町） 大津久港（隠岐郡隠岐の島町） 長尾田港（隠岐郡隠岐の島町） 別府港（隠岐郡西ノ島町） 波止港（隠岐郡西ノ島町） 宇賀港（隠岐郡西ノ島町） 美田港（隠岐郡西ノ島町） 物井港（隠岐郡西ノ島町） 倉の谷港（隠岐郡西ノ島町） 国賀港（隠岐郡西ノ島町） 知々井港（隠岐郡海士町） 御波港（隠岐郡海士町） 堤港（隠岐郡海士町） 保々見港（隠岐郡海士町） 須賀港（隠岐郡海士町） 日之津港（隠岐郡海士町） 諏訪港（隠岐郡海士町） 海士港（隠岐郡海士町） 来居港（隠岐郡知夫村） 古海港（隠岐郡知夫村） 竹名港（隠岐郡知夫村） 木佐根港（隠岐郡知夫村） 姫の浦港（隠岐郡知夫村）
56条港湾 論田港（安来市） 寺津港（松江市） 二子港（松江市） 手角港（松江市） 長江港（松江市） 秋鹿港（松江市） 岡本港（松江市） 湯町港（松江市） 寺津港（松江市）
岡山県 国際拠点港湾 水島港（倉敷市） 重要港湾 岡山港（岡山市） 宇野港（玉野市） 地方港湾 東備港（備前市） 寒河港（備前市） 鴻島港（備前市） 久々井港（備前市） 牛窓港（瀬戸内市） 布浜港（瀬戸内市） 間口港（瀬戸内市） 知尾港（瀬戸内市） 玉津港（瀬戸内市） 幡港（瀬戸内市） 網代港（瀬戸内市） 黄島港（瀬戸内市） 師楽港（瀬戸内市） 犬島港（岡山市） 米倉港（岡山市） 松尾港（岡山市） 山田港（玉野市） 江の浜港（玉野市） 石島港（玉野市） 後閑港（玉野市） 大藪港（玉野市） 野々浜港（玉野市） 渋川港（玉野市） 下津井港（倉敷市） 児島港（倉敷市） 大浜港（倉敷市） 松島港（倉敷市） 笠岡港（笠岡市） 北木島港（笠岡市） 豊浦港（笠岡市） 丸岩港（笠岡市） 小飛島港（笠岡市） 大飛島港（笠岡市） 大浦港（笠岡市） 前浦港（笠岡市）
広島県 国際拠点港湾 広島港（広島市・廿日市市・安芸郡海田町・安芸郡坂町） 重要港湾 福山港（福山市） 尾道糸崎港（尾道市・三原市・福山市） 呉港（呉市） 地方港湾 横田港（福山市） 阿伏兎港（福山市） 千年港（福山市） 中浜港（尾道市） 土生港（尾道市） 重井港（尾道市） 瀬戸田港（尾道市） 生口港（尾道市） 福田港（尾道市） 椋浦港（尾道市） 佐木港（三原市） 須波港（三原市） 忠海港（竹原市） 竹原港（竹原市） 鮴崎港（豊田郡大崎上島町） 木江港（豊田郡大崎上島町） 大西港（豊田郡大崎上島町） 安芸津港（東広島市） 御手洗港（呉市） 蒲刈港（呉市） 川尻港（呉市） 小用港（呉市） 釣士田港（呉市） 吉悪港（呉市） 波多見港（呉市） 奥の内港（呉市） 袋の内港（呉市） 大迫港（呉市） 小用港（江田島市） 中田港（江田島市） 三高港（江田島市） 大須港（江田島市） 鷲部矢の浦港（江田島市） 津久茂港（江田島市） 内海港（江田島市） 鹿田港（江田島市） 大柿港（江田島市） 鹿川港（江田島市） 厳島港（廿日市市） 大竹港（大竹市）
山口県 国際拠点港湾 下関港（下関市） 徳山下松港（周南市・下松市・光市） 重要港湾 岩国港（岩国市・玖珂郡和木町） 三田尻中関港（防府市） 宇部港（宇部市） 小野田港（山陽小野田市） 地方港湾 由宇港（岩国市） 柳井港（柳井市） 大畠港（柳井市） 久賀港（大島郡周防大島町） 安下庄港（大島郡周防大島町） 小松港（大島郡周防大島町） 伊保田港（大島郡周防大島町） 白木港（大島郡周防大島町） 沖浦港（大島郡周防大島町） 柱島港（大島郡周防大島町） 室津港（熊毛郡上関町） 平生港（熊毛郡平生町） 山口港（山口市） 山口東港（山口市） 秋穂港（山口市） 青江港（山口市） 丸尾港（宇部市） 厚狭港（山陽小野田市） 特牛港（下関市） 角島港（長門市） 油谷港（長門市） 萩港（萩市） 櫃島港（萩市）
56条港湾 日良居港（大島郡周防大島町） 油良港（大島郡周防大島町） 笠佐港（大島郡周防大島町） 沖浦西港（大島郡周防大島町） 埴生港（山陽小野田市） 小串港（下関市） 仙崎港（長門市） 深川港（長門市） 飯井港（長門市） 尾島港（萩市） 羽島港（萩市） 相島港（萩市） 須佐港（萩市） 肥島港（萩市） 田部港（阿武郡阿武町）
四国 徳島県 重要港湾 徳島小松島港（徳島市・小松島市） 橘港（阿南市） 地方港湾 折野港（鳴門市） 亀浦港（鳴門市） 撫養港（鳴門市） 粟津港（鳴門市・板野郡松茂町） 今切港（板野郡松茂町） 中島港（阿南市） 富岡港（阿南市） 日和佐港（海部郡美波町） 浅川港（海部郡海陽町） 那佐港（海部郡海陽町）
香川県 重要港湾 高松港（高松市） 坂出港（坂出市） 地方港湾 引田港（東かがわ市） 安戸港（東かがわ市） 白鳥港（東かがわ市） 三本松港（東かがわ市） 津田港（さぬき市） 猪塚港（さぬき市） 志度港（さぬき市） 坂手港（小豆郡小豆島町） 福田港（小豆郡小豆島町） 内海港（小豆郡小豆島町） 三都港（小豆郡小豆島町） 吉野崎港（小豆郡小豆島町） 室生北港（小豆郡小豆島町） 池田港（小豆郡小豆島町） 大部港（小豆郡土庄町） 北浦港（小豆郡土庄町） 馬越港（小豆郡土庄町） 江島港（小豆郡土庄町） 土庄港（小豆郡土庄町） 小瀬港（小豆郡土庄町） 土庄東港（小豆郡土庄町） 小豊島港（小豆郡土庄町） 家浦港（小豆郡土庄町） 牟礼港（高松市） 葛原港（高松市） 庵治港（高松市） 久通港（高松市） 立石港（高松市） 石場港（高松市） 長崎鼻港（高松市） 大島港（高松市） 女木港（高松市） 男木港（高松市） 直島港（香川郡直島町） 宮浦港（香川郡直島町） 風戸港（香川郡直島町） 屏風港（香川郡直島町） 木沢港（坂出市） 与島港（坂出市） 宇多津港（綾歌郡宇多津町） 丸亀港（丸亀市） 小浦港（丸亀市） 里浦港（丸亀市） 大浦港（丸亀市） 新在家港（丸亀市） 本島港（丸亀市） 生ノ浜港（丸亀市） 尻浜港（丸亀市） 手島港（丸亀市） 青木港（丸亀市） 江の浦港（丸亀市） 多度津港（仲多度郡多度津町） 見立港（仲多度郡多度津町） 高見港（仲多度郡多度津町） 佐柳港（仲多度郡多度津町） 詫間港（三豊市） 仁尾港（三豊市） 船越港（三豊市） 箱浦港（三豊市） 志々島港（三豊市） 粟島港（三豊市） 粟島西港（三豊市） 船隠港（三豊市） 室本港（観音寺市） 観音寺港（観音寺市） 豊浜港（観音寺市）
愛媛県 重要港湾 松山港（松山市） 今治港（今治市） 三島川之江港（四国中央市） 新居浜港（新居浜市） 東予港（西条市・新居浜市） 宇和島港（宇和島市） 地方港湾 寒川港（四国中央市） 宮浦港（今治市） 伯方港（今治市） 菊間港（今治市） 波止浜港（今治市） 吉海港（今治市） 波方港（今治市） 大見港（今治市） 上浦港（今治市） 岡村港（今治市） 大下港（今治市） 田ノ浦港（今治市） 早川港（今治市） 四坂港（今治市） 森上港（今治市） 前浜港（今治市） 古江港（今治市） 枝越港（今治市） 熊口港（今治市） 有津港（今治市） 北浦港（今治市） 弓削港（越智郡上島町） 小漕港（越智郡上島町） 西部港（越智郡上島町） 長江港（越智郡上島町） 生名港（越智郡上島町） 立石港（越智郡上島町） 北条港（松山市） 中島港（松山市） 堀江港（松山市） 西中港（松山市） 松前港（伊予郡松前町） 伊予港（伊予市） 長浜港（大洲市） 八幡浜港（八幡浜市） 川之石港（八幡浜市） 三崎港（西宇和郡伊方町） 伊方港（西宇和郡伊方町） 三机港（西宇和郡伊方町） 三瓶港（西予市） 吉田港（宇和島市） 玉津港（宇和島市） 岩松港（宇和島市） 御荘港（南宇和郡愛南町）
56条港湾 桜井河口港（今治市）
高知県 重要港湾 高知港（高知市） 須崎港（須崎市） 宿毛湾港（宿毛市） 地方港湾 甲浦港（安芸郡東洋町） 佐喜浜港（室戸市） 室津港（室戸市） 奈半利港（安芸郡奈半利町） 手結港（香南市） 久礼港（高岡郡中土佐町） 上ノ加江港（高岡郡中土佐町） 佐賀港（幡多郡黒潮町） 上川口港（幡多郡黒潮町） 下田港（四万十市） 下ノ加江港（土佐清水市） 以布利港（土佐清水市） 清水港（土佐清水市） 三崎港（土佐清水市） 下川口港（土佐清水市） あしずり港（土佐清水市）
九州・沖縄 福岡県 国際拠点港湾 博多港（福岡市） 北九州港（北九州市） 重要港湾 苅田港（京都郡苅田町） 三池港（大牟田市） 地方港湾 宇島港（豊前市） 芦屋港（遠賀郡芦屋町） 大島港（宗像市） 若津港（大川市） 大牟田港（大牟田市）
佐賀県 重要港湾 唐津港（唐津市） 伊万里港（伊万里市） 地方港湾 諸富港（佐賀市） 住ノ江港（杵島郡白石町・小城市） 鹿島港（鹿島市） 大浦港（藤津郡太良町） 呼子港（唐津市） 星賀港（唐津市） 仮屋港（唐津市・東松浦郡玄海町）
長崎県 重要港湾 長崎港（長崎市） 佐世保港（佐世保市） 厳原港（対馬市） 郷ノ浦港（壱岐市） 福江港（五島市） 地方港湾 茂木港（長崎市） 脇岬港（長崎市） 太田尾港（長崎市） 宮浦港（長崎市） 古里港（長崎市） 小口港（長崎市） 高島港（長崎市） 伊王島港（長崎市） 池島港（長崎市） 神ノ浦港（長崎市） 早岐港（佐世保市） 臼ノ浦港（佐世保市） 江迎港（佐世保市） 相の浦港（佐世保市） 大島港（佐世保市） 神崎港（佐世保市） 下田港（佐世保市） 島原港（島原市） 久山港（諫早市） 小長井港（諫早市） 田結港（諫早市） 城ノ下港（諫早市） 大村港（大村市） 平戸港（平戸市） 田平港（平戸市） 川内港（平戸市） 古江港（平戸市） 松浦港（松浦市） 調川港（松浦市） 床浪港（松浦市） 福島港（松浦市） 比田勝港（対馬市） 小茂田港（対馬市） 峰港（対馬市） 佐須奈港（対馬市） 仁田港（対馬市） 鹿見港（対馬市） 仁位港（対馬市） 竹敷港（対馬市） 曽ノ浦港（対馬市） 勝本港（壱岐市） 印通寺港（壱岐市） 森ノ浜港（壱岐市） 富江港（五島市） 玉ノ浦港（五島市） 岐宿港（五島市） 椛島港（五島市） 芦ノ浦港（五島市） 浜窄港（五島市） 瀬戸港（西海市） 肥前大島港（西海市） 崎戸港（西海市） 松島港（西海市） 太田和港（西海市） 瀬川港（西海市） 大瀬戸柳港（西海市） 七ツ釜港（西海市） 面高港（西海市） 小浜港（雲仙市） 多比良港（雲仙市） 西郷港（雲仙市） 神代港（雲仙市） 須川港（南島原市） 口ノ津港（南島原市） 堂崎港（南島原市） 長与港（西彼杵郡長与町） 時津港（西彼杵郡時津町） 彼杵港（東彼杵郡東彼杵町） 川棚港（東彼杵郡川棚町） 佐々港（北松浦郡佐々町） 榎津港（南松浦郡新上五島町） 有川港（南松浦郡新上五島町） 青方港（南松浦郡新上五島町） 若松港（南松浦郡新上五島町） 郷ノ首港（南松浦郡新上五島町） 曽根港（南松浦郡新上五島町） 小瀬良港（南松浦郡新上五島町）
56条港湾 東望港（長崎市） 三浦船津港（大村市） 獅子吼港（平戸市） 紐差港（平戸市） 大川原港（平戸市） 大塔港（平戸市） 久吹港（平戸市） 鯨ヶ浦港（平戸市） 岳崎港（松浦市） 三代港（松浦市） 三里港（松浦市） 原港（松浦市） 大川港（五島市） 淵ノ元港（五島市） 浜脇港（五島市） 折紙港（五島市） 毛吹港（五島市） カヅメ港（五島市） 小迎港（西海市） 阿房下港（西海市） 石田港（南島原市） 中の浦港（南松浦郡新上五島町）
熊本県 重要港湾 熊本港（熊本市） 三角港（宇城市・上天草市） 八代港（八代市） 地方港湾 荒尾港（荒尾市） 長洲港（玉名郡長洲町） 呑崎港（玉名市） 百貫港（熊本市） 河内港（熊本市） 姫戸港（上天草市） 合津港（上天草市） 上天草港（上天草市） 水俣港（水俣市） 本渡港（天草市） 大門港（天草市） 大浦港（天草市） 鬼池港（天草市） 高浜港（天草市） 牛深港（天草市） 天草港（天草市） 富岡港（天草郡苓北町） 上津深江港（天草郡苓北町） 都呂々港（天草郡苓北町） 日奈久港（八代市） 鏡港（八代市） 佐敷港（葦北郡芦北町） 田浦港（葦北郡芦北町）
大分県 重要港湾 大分港（大分市） 津久見港（津久見市） 別府港（別府市） 佐伯港（佐伯市） 中津港（中津市） 地方港湾 高田港（豊後高田市・宇佐市） 堅来港（豊後高田市） 臼野港（豊後高田市） 羽根港（豊後高田市） 国東港（国東市） 姫島港（東国東郡姫島村） 守江港（杵築市） 日出港（速見郡日出町） 佐賀関港（大分市） 臼杵港（臼杵市） 下ノ江港（臼杵市） 浦代港（佐伯市） 丸市尾港（佐伯市）
56条港湾 真玉港（豊後高田市） 小高島港（国東市）
宮崎県 重要港湾 宮崎港（宮崎市） 細島港（日向市） 油津港（日南市） 地方港湾 古江港（延岡市） 熊野江港（延岡市） 延岡港（延岡市） 延岡新港（延岡市） 平岩港（日向市） 美々津港（日向市） 内海港（宮崎市） 大島港（日南市） 外浦港（日南市） 大納港（串間市） 黒井港（串間市） 福島港（串間市）
56条港湾 高鍋港（児湯郡高鍋町）
鹿児島県 重要港湾 鹿児島港（鹿児島市） 名瀬港（奄美市） 西之表港（西之表市） 志布志港（志布志市） 川内港（薩摩川内市） 地方港湾 米之津港（出水市） 瀬戸港（出水郡長島町） 宮之浦港（出水郡長島町） 片側港（出水郡長島町） 指江港（出水郡長島町） 獅子島港（出水郡長島町） 長島港（出水郡長島町） 黒之浜港（阿久根市） 高之口港（阿久根市） 大漉港（阿久根市） 小漉港（阿久根市） 八郷港（阿久根市） 西方港（薩摩川内市） 里港（薩摩川内市） 長浜港（薩摩川内市） 桑之浦港（薩摩川内市） 江石港（薩摩川内市） 串木野新港（いちき串木野市） 新川港（南さつま市） 小浦港（南さつま市） 平崎港（南さつま市） 松ヶ浦港（南九州市） 西塩屋港（南九州市） 聖ヶ浦港（南九州市） 東塩屋港（南九州市） 指宿港（指宿市） 宮ヶ浜港（指宿市） 魚見港（指宿市） 瀬崎港（指宿市） 桜島港（鹿児島市） 喜入港（鹿児島市） 桜島港（鹿児島市） 加治木港（姶良市） 隼人港（霧島市） 福山港（霧島市） 垂水港（垂水市） 浮津港（垂水市） 二川港（垂水市） 鹿屋港（鹿屋市） 高須港（鹿屋市） 大根占港（肝属郡錦江町） 根占港（肝属郡南大隅町） 大泊港（肝属郡南大隅町） 浜尻港（肝属郡南大隅町） 内之浦辺塚港（肝属郡肝付町） 大浦港（肝属郡肝付町） 岸良港（肝属郡肝付町） 波見港（肝属郡東串良町・肝付町） 硫黄島港（鹿児島郡三島村） 竹島港（鹿児島郡三島村） 片泊港（鹿児島郡三島村） 大里港（鹿児島郡三島村） 田之脇港（西之表市） 大久保港（西之表市） 大崎港（西之表市） 伊関港（西之表市） 浅川港（西之表市） 王籠港（西之表市） 馬毛島岬港（西之表市） 椎ノ木港（西之表市） 立山港（西之表市） 上ノ古田港（西之表市） 浜津脇港（熊毛郡中種子町） 屋久津港（熊毛郡中種子町） 増田港（熊毛郡中種子町） 牧川港（熊毛郡中種子町） 大塩屋港（熊毛郡中種子町） 島間港（熊毛郡南種子町） 広田港（熊毛郡南種子町） 田尻港（熊毛郡南種子町） 門倉港（熊毛郡南種子町） 宮之浦港（熊毛郡屋久島町） 上屋久元浦港（熊毛郡屋久島町） 安房港（熊毛郡屋久島町） 栗生港（熊毛郡屋久島町） 楠川港（熊毛郡屋久島町） 椨川港（熊毛郡屋久島町） 湯向港（熊毛郡屋久島町） 岩屋泊港（熊毛郡屋久島町） 上屋久永田港（熊毛郡屋久島町） 屋之間港（熊毛郡屋久島町） 小島港（熊毛郡屋久島町） 湯泊港（熊毛郡屋久島町） 中間港（熊毛郡屋久島町） 鯛ノ川港（熊毛郡屋久島町） 中之島港（鹿児島郡十島村） 前之浜港（鹿児島郡十島村） 元浦港（鹿児島郡十島村） やすら浜港（鹿児島郡十島村） 南之浜港（鹿児島郡十島村） 切石港（鹿児島郡十島村） 宝島港（鹿児島郡十島村） 小宝島港（鹿児島郡十島村） 東之浜港（鹿児島郡十島村） 七ツ山港（鹿児島郡十島村） 湾港（大島郡喜界町） 喜界島港（大島郡喜界町） 知名瀬港（奄美市） 山間港（奄美市） 赤木名港（奄美市） 大笠利港（奄美市） 屋仁港（奄美市） 和野港（奄美市） 戸口港（大島郡龍郷町） 竜郷港（大島郡龍郷町） 円港（大島郡龍郷町） 芦徳港（大島郡龍郷町） 大和港（大島郡大和村） 湯湾港（大島郡宇検村） 名柄港（大島郡宇検村） 古仁屋港（大島郡瀬戸内町） 与路港（大島郡瀬戸内町） 加計呂麻港（大島郡瀬戸内町） 篠川港（大島郡瀬戸内町） 請島港（大島郡瀬戸内町） 管鈍港（大島郡瀬戸内町） 亀徳港（大島郡徳之島町） 母間港（大島郡徳之島町） 平土野港（大島郡天城町） 鹿浦港（大島郡伊仙町） 面縄港（大島郡伊仙町） 和泊港（大島郡和泊町） 伊延港（大島郡和泊町） 住吉港（大島郡知名町） 与論港（大島郡与論町） 百合ヶ浜港（大島郡与論町）
沖縄県 重要港湾 那覇港（那覇市） 平良港（宮古島市） 石垣港（石垣市） 運天港（国頭郡今帰仁村） 金武湾港（うるま市・国頭郡金武町） 中城湾港（うるま市・沖縄市・中頭郡北中城村・中頭郡中城村・中頭郡西原町・島尻郡与那原町・南城市） 地方港湾 奥港（国頭郡国頭村） 塩屋港（国頭郡大宜味村） 古宇利港（国頭郡今帰仁村） 水納港（国頭郡本部町） 本部港（国頭郡本部町） 伊江港（国頭郡伊江村） 前泊港（島尻郡伊平屋村） 野甫港（島尻郡伊平屋村） 仲田港（島尻郡伊是名村] 内花港（島尻郡伊是名村） 宜野湾港（宜野湾市） 徳仁港（南城市） 兼城港（糸満市） 粟国港（島尻郡粟国村） 渡嘉敷港（島尻郡渡嘉敷村） 座間味港（島尻郡座間味村） 安護の浦港（島尻郡座間味村） 慶留間港（島尻郡座間味村） 北大東港（島尻郡北大東村） 南大東港（島尻郡南大東村） 来間港（宮古島市） 前浜港（宮古島市） 長山港（宮古島市） 多良間港（宮古郡多良間村） 水納港（宮古郡多良間村） 白浜港（八重山郡竹富町） 祖納港（八重山郡竹富町） 上地港（八重山郡竹富町） 竹富東港（八重山郡竹富町） 小浜港（八重山郡竹富町） 鳩間港（八重山郡竹富町） 船浦港（八重山郡竹富町） 仲間港（八重山郡竹富町） 船浮港（八重山郡竹富町） 黒島港（八重山郡竹富町）