新潟少女監禁事件（にいがたしょうじょかんきんじけん）は、1990年（平成2年）11月13日夕方に新潟県三条市の農道で、少女A（当時9歳・小学校4年生）が青年Sにより誘拐され、同県柏崎市四谷一丁目の加害者宅2階の一室に監禁された事件。柏崎女性監禁事件、新潟少女誘拐事件と呼称される場合もある。事件発覚前は新潟少女行方不明事件とも呼称されていた。
約9年2か月後（3,364日後）の2000年（平成12年）1月28日、加害者である青年S（当時37歳）の母親は日頃から息子であるSに暴行を受けており「息子の家庭内暴力に悩んでいる」と相談を受けた医師や保健所の職員らが、青年Sを強制入院させるために現場の住宅を訪れたところ、同宅2階で、ベッドで毛布に包まり横になる19歳になっていた被害者少女Aを発見・保護した。
訪れた新潟県警によって逮捕された加害者Sは、被害者少女Aを誘拐して自宅に監禁したとして、未成年者略取・逮捕監禁致傷罪で起訴されたほか、1998年（平成10年）10月上旬にAに着せるための下着を万引きしたとして、窃盗罪でも追起訴された『読売新聞』2000年6月27日東京朝刊第一社会面39頁「新潟女性監禁事件 地検、S被告を万引きでも追起訴 量刑、最高で15年に」（読売新聞東京本社）。
刑事裁判では、被告人Sの量刑と、それに影響する併合罪の解釈をめぐって最高裁まで争われたが、2003年（平成15年）に最高裁で懲役14年の刑が確定。千葉刑務所に収監された受刑者Sは、2015年（平成27年）4月に刑期を終え刑務所を出所したが、2017年（平成29年）に千葉県内のアパートの一室で孤独死した。詳しい死因は判明されていないが、病気が原因と考えられている。
犯行期間が約9年2か月という長期にわたっていたことや、事件に関わる新潟県警の捜査不備・不祥事（#新潟県警の不祥事を参照）が次々と発覚したことなどから社会的注目を集めた。また、犯人が無職で長期の引きこもり状態にあったことから、同様の状態にあった男が同年（本事件発覚後）に起こした西鉄バスジャック事件とともに、引きこもり問題の社会的認知度を大きく高めた事件ともなった。新潟県の県紙『新潟日報』（新潟日報社）は、2000年の「県内10大ニュース」の1位および、「国内10大ニュース」の8位として、本事件とそれに関連する県警の不祥事を選出した『新潟日報』2000年12月30日朝刊特集面15頁「2000年10大ニュース 県内 止まらない 謝罪 釈明 県警、病院、ミス続発 真衣選手「銀」力泳に興奮」（新潟日報社）『新潟日報』2000年12月30日朝刊特集面14頁「2000年10大ニュース 国内 17歳の凶行に心寒く きばむく自然の脅威 モラル低下 信頼揺らぐ」（新潟日報社）ほか、第一審・控訴審の判決が言い渡された2002年（平成14年）には「県内10大ニュース」の6位として本事件を選出した『新潟日報』2002年12月29日朝刊特集面10頁「2002年県内10大ニュース 国家犯罪に衝撃と怒り 拉致 全容解明道半ば W杯の熱狂、歴史を刻む」（新潟日報社）。
事件の経緯 犯人の生い立ち 犯人の青年Sは1962年（昭和37年）7月15日『柏崎日報』2000年2月16日号（第29061号）1頁「女性監禁事件 市民の気持ちに重く… 裕福に育った容疑者 屈折した言葉なぜ 社会とプライバシー 難しい問いかけ」（柏崎日報社）、柏崎市で生まれた。Sの父親は戦後、東京で大会社の重役を送迎する運転手をしていたが、帰郷してタクシー会社を設立。最初の妻との間に5人の子供をもうけていたが、妻に先立たれ、57歳の時にSの母親（当時30歳）を後妻として迎え、61歳のときに当時35歳の妻と再婚。Sは父親が62歳、母親が36歳の時に出生し、両親から溺愛されて育てられた。 Sは地元の幼稚園を経て、市内の小学校に入学した。Sが小学1年の時、Sの父親は柏崎市四谷一丁目に家を新築し、2階の十畳ほどの洋間を息子Sの子供部屋として与えた。この部屋が後の事件の舞台となる。
Sは市内の中学校に進学し、親の勧めでテニス部に入部したが、本人は入部には乗り気ではなく、入部直後に練習を休んだことを顧問に叱られ、罰走を命じられて退部した『越後タイムス』2000年2月11日号（第4197号）1頁「誘拐監禁男性の中学の思い出」（越後タイムス社）。その後は他の部活動にも興味を持てずにいたが、中学3年のころに野球に興味を持ち、バッティングセンターに通ったり、器械体操で減量に取り組んだりもしていたが、本人は卒業文集で中学生活を「おもしろかったようだが、嫌な事ばかりの3年間だった」と総括している。中学1年の時、Sが「怖くて学校に行けない」ということで精神科の診察を受けたところ不潔恐怖症と診断される。なお、会社でタクシーの事務所やガレージの清掃や片付けを日常的にしていたSの父親も同じく不潔恐怖症であった。Sは虫を毛嫌いし、わずかな汚れも気にした。このころになると、70代半ばを過ぎた父親はSにとって薄汚れて見える存在になっており、Sは「あんなの親父じゃない」と疎んでいた。また、母に対し「自分の父はなんで高齢なんだ」「なんで結婚したんだ」と不満をぶつけていたという報道もある。
中学校卒業後、Sは柏崎工業高校機械科に進学し、1981年（昭和56年）に卒業した。高校入学後には野球部でエースを目指して入部したが、約1、2か月で退部した。高校時代、Sは体格が大きく、身長は175cmほどあったが、覇気が無くなよなよした話し方から「オカマ」「カマホモ」と呼ばれており、クラスメイトからいじめを受けていた。このころから自分の殻に閉じこもるようになり、家の中で鬱憤を晴らすようになっていた。
高校卒業後 高校を卒業後、Sは市内に進出していた機械精密部品製造会社に就職したが、それから3か月後の研修期間中に退社した『越後タイムス』2000年2月4日号（第4196号）1頁「タイムス秒 驚愕、9年2カ月の誘拐監禁」（越後タイムス社）。出勤途中に立小便をした際に「クモの巣にかかって汚れた」と家に引き返すなどといった奇行が続いて数か月で退職したものであり、以降は本事件で逮捕されるまで全く働いていなかった。
1981年（昭和56年）7月、当時19歳のSは父親を家から追い出す。生命保険会社で働く母親と2人暮らしになったが、その半年後には母親と口論になり、「私も出て行く」と言われたため激昂し家の仏壇に火をつけ、危うく火事になりかけた。長岡市の国立病院の精神科にて強迫神経症（不潔恐怖）と診断される。即日入院し、向精神薬を投与された。この時は1か月ほどで良くなり退院する。
1985年（昭和60年）夏、当時23歳のSは母親に「僕もそろそろ自立しなければならない。お母さんにいつまでも甘えているわけにはいかないので、独立して生活できるように家を増築してほしい」と話す。息子が就職口を見つけて真面目に働くと思った母親は直ちに700万円で家の増築を決めたが、Sが2階の自室に工事業者が立ち入ることを頑に拒否したため、増築は中途半端なまま中止となり、就職の約束も反故にされた。
Sは、母親に対しては、好きなアイドル歌手のレコードや競馬新聞などを買いに行かせており、この母親は商店の人たちの間で、ある種の有名人となっていた。また、Sは新潟競馬場・三条競馬場へ馬券を買うために通っていたとされるが、その行き帰りも母親が車で送迎しており、レースが終わるまでベンチに腰かけて待っている母親の姿が、競馬場の常連の間でも知られていた。Sが競馬に勝つと、母親になじみの寿司屋で極上のトロのにぎり10個（8,000円分）を買わせることが何度かあった。
強制わいせつ罪で執行猶予 1989年（平成元年）6月13日『毎日新聞』2000年2月12日東京朝刊社会面26頁「新潟・女性監禁事件の経過」（毎日新聞東京本社）、Sは柏崎市宮川の国道で、下校する小学生を小学校の正門付近で待ち伏せ、同校4年生の女児（当時9歳）を尾行して道路脇の空き地（小学校から約300m）に拉致し、強姦を試みた。しかし、学校から約100m離れた国道脇で被害女児と同じ学校に通う上級生2人が、被害女児が不審な男に抱き抱えられている様子を目撃して学校に伝え、Sはそれを聞いて駆けつけた教職員らに取り押さえられた『柏崎日報』1989年6月21日付（第25964号）2頁「柏崎署 わいせつ未遂事件で お手柄2氏に感謝状」（柏崎日報社）。現場付近を通りかかった車に乗っていた人が110番通報に協力し、同日17時30分前『柏崎日報』1989年6月14日付（第25958号）2頁「少女にいたずら未遂」（柏崎日報社）、Sは学校近くの柏崎警察署宮川駐在所で、強制わいせつ未遂容疑で現行犯逮捕された『読売新聞』1989年6月14日東京朝刊第12版新潟県地方面22頁「わいせつ未遂で逮捕」（読売新聞東京本社・新潟支局）。当時は東京・埼玉連続幼女誘拐殺人事件が発生していただけでなく、新潟県内でも巻警察署や燕警察署の管内で下校途中の男子児童が誘拐されかける事件があり、柏崎署管内でも児童が不審な男に声をかけられたという届け出があり、同校でも教職員を通じて注意をしていた矢先の事件だった。
その後、Sは警察の取り調べで「既遂」を認め、被害者側の親告（親族による告訴）もあり、新潟地検長岡支部により強制わいせつ罪で起訴された。同年9月19日、Sは新潟地裁長岡支部で懲役1年・執行猶予3年の有罪判決を受けた（同年10月5日に確定）。当時、新潟地裁長岡支部の裁判官は「再犯の可能性は低い」として、保護観察処分ではなく、Sの母親に監督・指導を任せた。
また、柏崎署と新潟県警本部は、この時に強制わいせつで検挙したSを「前歴者リスト」に登録しておらず、刑が確定した後も登録漏れのまま放置していた。なお、同事件から2か月後の1989年8月28日には、Sの父親が89歳で死去している『柏崎日報』2000年2月12日号（第29058号）1頁「女性監禁の市内男逮捕 容疑を大筋で認める 被害者の心身両面に傷害 身柄を三条署に護送」「家で暴力、すさんだ生活 母親はでき愛しつつも脅える」（柏崎日報社）。Sの父親は晩年、老人介護施設に入所しており、最期まで息子の将来を心配していたが、Sは父親の葬儀に参列しなかった。
被害者少女Aを誘拐 執行猶予中（1回目の逮捕から約1年5か月後）の1990年（平成2年）11月13日15時ごろ、S（当時28歳）は母親の乗用車を運転して1人でドライブに出掛け、長岡市内を経由し、幹線道路である国道8号を新潟市方面へ向かって走った。そして三条市付近に至ったところで、国道8号から脇道の農道に入り、17時ごろに三条市内の農道上で、本事件の被害者である少女A（当時9歳・小学校4年生）を誘拐した。現場は三条市街地の南側にある田園地帯を走る農道で、学校からA宅までは直線で約1km離れており、途中は変電所の建物を除いてほとんど建物はなかった『柏崎日報』2000年2月1日号（第29049号）1頁「誘拐監禁事件 捜査は長期戦か 女性は少しずつ回復へ」「女性の行方不明当時 事件の男性は全く浮かばず」「三条に土地勘 競馬雑誌を毎週購入」（柏崎日報社）。
Sは乗用車で単身移動中、三条市内の農道において下校途中の少女Aを発見し、誘拐を決意。いったんAを車で追い抜いてから目前で停車し、ナイフ（刃体の長さ約13cm）を手にして降車し、Aへ接近した。そして、Aの腹にナイフを突きつけて「おとなしくしろ。声を出すな」などと脅迫し、身動きできないAの背後に回って車の後部に連行した。そして、車のトランクを開け「入れ」と指示したが、Aが入ろうとしなかったため、身体を抱え上げて押し込め、トランクを閉めて車を発進させた。Sは柏崎市内の自宅にAを連行し、一緒に暮らそうと考え、同市方面へ向かったが、その途中の18時30分-19時ごろ、柏崎市内の北陸自動車道の高架下の路上に車を停めてトランクを開け、トランク内に監禁していたAの様子を確認した後、粘着テープでAの両手足を緊縛し、目隠しもした。そして再度、Aをトランクに押し込ませたままトランクパネルを閉め、再び自宅に向かい、同日20時ごろに到着した。
自宅に到着したSは、日ごろ二人暮らしをしている母親にAを見られないよう、母屋の正面玄関ではなく家の増築部分（後述）の玄関前に停車、Aを抱えて自室のある2階に上がりAを自室南側の窓枠に置いたのち、改めて正面玄関前に車を回して普通に帰宅したように装いながら自室に赴き、窓枠に置いてあったAを自室に入れ、目隠しを外した。そして、Aに対し「誘拐されて殺されちゃった女の子みたいにおまえもなってみたいか」などと脅迫的な言葉を浴びせ、以後継続的な監禁を開始した。
少女捜索の状況 少女Aが誘拐された1990年11月13日19時45分ごろ、Aの母親は「娘が帰ってこないので捜してください」と駐在所に捜索願を出した。これを受け、新潟県警察の所轄警察署である三条警察署と学校関係者100人以上、翌14日には200人以上がAの捜索に当たったが手掛かりさえ見つけることができず、15日から三条署内に県警機動隊、機動捜査隊など107名で構成された「女子小学生不明事案対策本部」が設置された。以後、捜索範囲は周辺市町村にも拡大され、ヘリコプターによる空からの捜索、廃墟やコンテナボックスの内部などの捜索や、夜間検問も実施された。三条署の対策本部は11月16日、ビラ2,000枚を市内と隣接する町村に配布したほか、三条市教育委員会も全小中学校を対象に、「夏休みの後、不審者から声をかけられたり、誘われたりしたことはなかったか」とアンケート調査を実施した。17日、対策本部はAの顔写真入り手配書を20,000枚作成し、県内全域に配布したほか、さらに24日に別の手配書1,000枚を新たに配布したが、有力な情報はもたらされなかった。当時の警察担当記者によれば、事案発生から数週間後に車による連れ去り事件であるとの見方が支配的になり、捜査一課が投入されたが、そうした見方が強まったことは却って捜査員たちに諦念を抱かせた。また、少女Aが失踪した現場は幹線道路から外れ、土地勘のあるものでないと入らないような場所だったため、土地勘のある犯人像が有力視された。そのため、三条市や燕市など県央地域で、同種事件を起こしたことのある人物を1,000人以上リストアップするなど、重点的な捜査が行われた一方、Sの住んでいた柏崎市は重点捜査の対象にされなかった。
なお、当時この事件を報じていた『新潟日報』の記事では、秋・夕方の下校途中に車で何者かに連れ去られたという部分が、1977年（昭和52年）に新潟市で行方不明になり、後に北朝鮮工作員に拉致されたことが判明した横田めぐみ（失踪当時13歳・新潟市立寄居中学校1年生）の失踪事件に類似するという旨が指摘されており、また1995年（平成7年）頃にはオウム真理教事件が社会問題となったため、オウム真理教や北朝鮮の関与を疑う者もいたほか、副次的な事件として、1991年（平成3年）1月下旬から4月下旬にかけ、Aの家に「娘を預かっている。会わせてやるから出て来い」などと嘘の電話を繰り返しかけたり、同年3月2日に三条市下須頃のレストランへAの母親を呼び出したりしたとして、同年6月に新潟市在住の男が強要容疑で三条署に逮捕されるという事件もあった。同事件で県警や三条署は、不安な思いの家庭を脅迫した悪質性を重視して脅迫罪より重い強要罪を適用した『新潟日報』1991年6月14日夕刊総合面1頁「三条 「A預かってる」いたずら電話12回 強要で会社員を逮捕」（新潟日報社）。
捜索は11月19日に人員が80人規模に縮小され、12月25日には地元消防団などによる捜索が打ち切られた。翌1991年4月23日 - 25日には再び県警による捜索活動が行われたが手掛かりは発見できず『朝日新聞』1991年4月26日東京朝刊第12版新潟北部版27頁「Aちゃん不明5カ月 再捜索、手がかりなし 聞き込み捜査続行」（朝日新聞東京本社・新潟支局）、このころには市民の協力情報も途絶えていた『毎日新聞』1991年6月14日東京夕刊第4版第一社会面15頁「不明の女児宅に「会わせてやる。出て来い」 偽電話3カ月 新潟で会社員逮捕」（毎日新聞東京本社） - 縮刷版567頁。。以後は専従捜査員30人体制で聞き込みなどを中心とした捜査が進められ『新潟日報』1991年4月26日朝刊社会面26頁「三条の少女不明 手掛かりないまま捜索を打ち切る」（新潟日報社）、毎年（1991年 - 1999年（平成11年））11月13日、三条署員が当時Aの通っていた小学校や周辺の道路上など、三条市を含む県央地域で情報提供を呼びかけるチラシを配布し、地元のマスコミもその様子の取材を続けるなど、事件の風化を心配し、市民の関心を呼び起こしてきた。三条市PTA連合会はAの行方不明事件を機に、市内の小中学校22校の危険箇所の指摘や、通学路の安全確保のための資料を作成し、これを三条市PTA連合会がまとめ上げて市に提案した一方、三条署は事件発生直後、Aの失踪を事件と断定せず「事案」として扱い、情報提供を求めるポスターの配布にも及び腰だったため、当時連合会の会長を務めていた男性は「三条署がAの失踪直後から事案ではなく、事件として真剣に対処していれば、Aを早期発見できたのではないかと悔しくてならない」と述べている - 。
監禁の状況 SはAに対し、脅迫的な文言を繰り返し浴びせる、ナイフを突きつけた上で、最初の2-3か月間は自身の外出や就寝の際にはAの両手足を緊縛して身動きが取れないようにしていた。その後、両手の緊縛は解かれた。Aの脱出意志を喪失させた。Aに対しては大声を出さないこと、家の構造を知られ逃走されるのを防ぐため、Sが部屋を出入りする際には顔を隠したり後ろを向いたり毛布に潜ったりすること、自室のセミダブルベッドから許可なく降りないこと、暴れないことなどを命令し、これを破った際には暴行を加えた。1-2年目からは暴行の道具としてスタンガンを使用し始めたが、Aは「叫び声を上げたら刺されると思い」自分の身体や毛布を噛むなどして声をあげることなく耐えた。また、プロレス技を掛けられAが苦痛に声をあげたときなどにも暴行が加えられた。Sは監禁期間中、軽い殴打は700回程度、力を込めた殴打は200から300回程度に及んだと供述している。Aはある時期から、目を殴られると失明すると思い自ら頬を差しだしたり、スタンガンの痛みに慣れるため自らの身体に使用するといった行動もとるようになり、また、暴行を受けている最中に「殴られているのは自分ではない」と第三者的立場を仮想して防衛機制を働かせる解離性障害の症状も出ていた。
食事は当初、Sの母親が息子Sの夜食用に用意していた重箱詰めの弁当が与えられていたが、高齢であった母親の負担を考慮したSが自らコンビニエンスストアで売られている弁当に切り替えた。さらに1996年（平成8年）ごろ、SがAの足に痣ができているのを発見、Sはこれを高タンパク由来のものと考え糖尿病に進行することを危惧し、「運動をしない以上、減らすしかないと思い」Aの食事を1日1食に減らした。数か月後からAは体調を悪化させていった。Sが計測すると46kgあった体重が38kgまで減少しており、Aは失神を起こすようになったが、Sの対応は弁当におにぎりを一つ足したのみであった。長らくベッドの上で行う脚部の屈伸がAに許されていた唯一の運動であり、その後糖尿病予防のため床上での足踏みが許されたが、階下に母親がいる場合には存在を気取られないため、それも禁止された。Aの筋肉は著しく萎縮し、Sの腕や壁に掴まってようやく立てる状態であった。発見後の検査では著しい栄養不良に加え、両下肢筋力低下、骨粗鬆症、鉄欠乏性貧血などが認められ、通常歩行は厳しい状態だった。また排泄は、潔癖症のためトイレが使えずビニール袋に排泄していたSに倣わせ、排泄後の袋は部屋の外の廊下に放置されていた。Sは自分が部屋を出るときにAに顔を覆わせていた理由について「廊下にビニール袋が並んでいるのを見られたくなかったから」とも述べている。こうした環境下に置きながら、Aが監禁中に入浴したのは、1992年（平成4年）-1993年（平成5年）ごろにSの母が不在の際、ベッドから転落して埃まみれになり、目隠しをしたまま1階の浴室でシャワーを浴びせられたことが1回あるのみだった。
虐待の一方で、SはAに対して愛情を持っていたため、SはAに本や新聞などを与えたほか、1999年頃にはAを喜ばせるために29インチのテレビを購入している。また、テレビ、ラジオで流れるニュースなどの内容や、Sの嗜好する事柄についてAと語り合うことを好んだ。時事についての議論は、「彼女の考えが子供のままでいないように」するためであったとし、またAの将来を考え、勉強を教えることもあった。裁判では「因数分解なんかは世の中で役に立たないと思うけど、比例式は覚えた方が良いので教えました」と供述している。Aが保護された後に行われた検査では、Aには一般の同年代人と比較して知的レベルに目立った低下は見られず、知識量や語彙においても目立った遅れはないとされた。裁判で被告人Sの弁護人は、このことはSがAに情報・知識を与えるよう努めたことが寄与しているとして、酌量を求める材料のひとつとした。SはAを「友達」と認識しており、裁判では「被害者は、私の言いつけを本当によく守るようになりました。これからも一緒に暮らしたいと思いました。競馬や自動車など、対等に話ができた。被害者のことは、基本的に好きだった。同世代の女性と思っていた。かけがえのない話し相手だったので、解放したくありませんでした」と供述し、また初公判で読み上げられたAの供述調書の内容に、「自分はうまくやっていたと思っていたのに、実は恨まれていたんだとわかった」と述べた。
Sの生活状況 前述のようにSは高校卒業後、2人暮らしの母親の勧めで機械部品の製造会社に就職したが、人間関係がうまくいかないことを理由に3か月で退職し、以来引きこもりの状態にあった。一時は母親からの自立を目指し、母親に対し自宅に独立した居住スペースを設けることを求め母親もこれに応じたが、持病としていた不潔恐怖をはじめとする強迫性障害の症状を悪化させつつあり、大工の出入りに対して「他人が部屋に入ってくるのが嫌だ」と増築工事を中止させ、変わらない生活を続けていた。Aの監禁を始める数年前から家庭内では障子や窓ガラスを破壊するといった行動を見せており、監禁開始から5年あまり後の1996年1月には母親が保健所に赴き、息子Sの家庭内暴力を訴えた。職員は家庭訪問を打診したが母親はSが暴れ怪我を負わされる可能性があるとしてこれを断り、代替案として指示された精神病院に赴き、そこで向精神薬を処方され、Sはこれを服用していた。
このころには母親の保険外交員としての仕事もほとんど無くなっていた。若いころに実績を上げていたため、60歳の定年を5年延長できた上に定年退職後も嘱託として仕事を続けることはできたが、既に契約はほとんど取れなくなっていた。Sの暴力が激しくなり、怯えた母親は10時-16時まで500円で居続けることのできるかんぽの宿で時間をつぶすことが多かったという。
1999年（平成11年）ごろから、Sは母親に対してもスタンガンを使用し始め、同年12月に再び精神病院を訪れた母親は「このところ息子の暴力がひどい。自分の意のままにならないと殴る蹴るのうえに、私を縛り付けて、トイレにさえ行かしてくれない」と、Sの家庭内暴力が激しさを増していることを訴えた。担当医師は強制的手段として医療保護入院（強制入院）を提案し、母親もこれに同意したことから、翌2000年（平成12年）1月19日にはその是非を判断するため、保健所職員と柏崎市職員がS宅を訪れたが、Sが部屋に閉じこもったため面会はできなかった。後日、精神病院、保健所、市役所などが協議を行い、医療保護入院の実施日が決定され、それに向けて専門チームも作られた。
少女Aの保護 2000年1月28日13時30分ごろ、Sを医療保護入院させる措置を実施するため、医療関係者5人と保健所職員および市職員の男性計7人が3台の車に分乗して被疑者宅を訪れた。S宅前で2人が待機し、残る5人がSの部屋のあった2階へ上がり、精神保健指定医が「お母さんの依頼で診察に参りました」と告げ、返事を待たず部屋に入った。ベッドで寝ていたSはこれに気付き「なんで入ってくるんだ！」と抗議したが、これに対し指定医が法律を説明し、「あなたは入院が必要であると認定されました」と告知すると、Sは癇癪を起こし暴れ出した。警察の応援が必要であると判断され、事前に医療保護入院があることを通知していた柏崎警察署生活安全課に対し、警官3名の派遣を要請したが、男性の課員が出払っていたため、彼らに連絡を取ったのち折り返し電話する旨が保健所職員に伝えられた。なおも暴れるSに対し、医師が鎮静剤を注射。効果が現れるまでSは抵抗を続けたが、やがて鎮静化し眠りに落ちた。
その後、関係者の注意は騒動の間にも動いていた様子があった毛布の塊に向けられた。市職員が不審に思い毛布をハサミで切り開くと、中から若い女性（A）が現れた。市職員は「あなたは誰ですか。話をしてください」「名前は？どこから来たの」などと問い掛けたが、少女は口ごもり「気持ちの整理が付かないから」と話した。要領を得ないため、指定医が階下にいたSの母親を呼び出し、「この女性は誰か」と訊ねたが、母親は「知りません。顔を見たこともない」と答えた。
指定医は少女に「一緒にいた（被疑者）人は入院することになったので、ここにはいつ帰ってくるか分かりません。あなたはどうしますか」と訊ねると、少女は母親に向けて「ここにいても、いいですか」と訊ねる。市職員らが「そういう問題じゃないでしょ。家の人に連絡しないとだめよ」とたしなめると、少女は「私の家は、もうないかもしれない」と話した。また、母親の裁判での供述によると、母親が「あなたのお家はどこ？」と訊ねると、少女は「ここかもね」と答えたとされる。新潟地裁（2002年）によれば、少女Aは「2000年1月28日午後2時ころ（＝14時ごろ）」までS宅に監禁されていた。
その後、医師1人とサイコソーシャルワーカー（PSW）の看護師、病院職員1人がSとともに車に乗り、Sの母親はもう1人の医師とともに、少女Aは柏崎市および病院の職員とともにそれぞれ別々の車に分乗し、近郊の病院へ向かった。被疑者宅に残った保健所職員の携帯電話には、柏崎署から折り返しの連絡が届き、人員の都合がつかないと伝えられた。これに対し職員はSが鎮静化し病院に向かったことと、同時に身元不明の女性が見つかった旨を伝え、警察官の出動を改めて要請したが、電話口の生活安全課係長は「そちらで住所、氏名を聞いてくれ。そんなことまで押しつけないでくれ。もし家出人なら保護する」と返答し、事実上出動を拒否した。
病院へ向かう車中で病院職員が少女に改めて名前を尋ねると、少女（A）は自身の名前と住所、生年月日、両親の名前などを答えた。その情報に覚えがあった職員は、三条市で行方不明となったAに思い当たり、病院到着後に少女から聞いた番号へ電話を掛けたが、この時は呼び出し音が鳴ったものの、誰も出なかった。職員は次いで柏崎署に連絡を取り、「家にいた女の人の名前が分かりました。三条で行方不明になったAだと名乗っている。少女は『数年前に連れてこられてから一歩も外に出ていない』と話している。Aの家に電話をしたが出なかった。いま病院にいるので、すぐ来てください」と要請した。これを受け、柏崎署から刑事課の捜査員3名が病院へ急行し、Aを伴って再び柏崎署に戻った後、指紋の照合が行われ、発見された少女が三条市で行方不明になったAと同一人物であることが確認された。同日の夕方には三条市からAの母親が駆けつけ、娘と9年2か月ぶりの再会を果たした。
一方、同じく病院に搬送されたSはそのまま医療目的で収容された。新潟県警は早期の身柄引き渡しを要求したが、院長はSが医療保護入院の目的で投与された鎮静剤により昏睡中であることから、「医者は患者の生命と身体を守ることが目的で、継続している医療行為の責任を取らずに警察に身柄を引き渡すことはできない」との判断を下し、医療優先の方針を伝え、これを了承された。