マリア・アンナ・フォン・バイエルン（Maria Anna von Bayern, 1574年12月8日 - 1616年3月8日）は、神聖ローマ皇帝フェルディナント2世の最初の妃。フェルディナントの帝位継承以前に亡くなったため、皇后とならなかった。
生涯 バイエルン公ヴィルヘルム5世とレナータ・フォン・ロートリンゲンの娘としてミュンヘンで生まれた。1600年4月、グラーツのグラツェル大聖堂でフェルディナントと結婚。7子をもうけた。 クリスティーネ（1601年、夭折） カール（1603年、夭折） ヨハン（1605年 - 1619年） フェルディナント（1608年-1657年） - 神聖ローマ皇帝 マリア・アンナ（1610年 - 1665年） ツェツィーリア・レナータ（1611年 - 1644年） レオポルト（1614年 - 1662年） - スペイン領ネーデルラント総督