ハエ亜目（短角亜目、Brachycera）は、ハエ目（双翅目）に属する分類群の一つ。いわゆるハエ、アブを含む大きなグループである。
概要 thumb|180px|イエバエ（イエバエ科）の頭部 ハエ亜目は世界中に分布する分類群で、現生種だけで約95科約80000種が記録されている。約200万年以上前に分岐して発生した分類群と考えられており、現生で非常に繁栄しているグループの一つである。ハエ亜目に属する種は形態的、生態的に非常に多様で、同じ双翅目に属するカ亜目よりはるかに多様度が高い。
ハエ亜目の学名 Brachycera は、ギリシャ語で「短い角」（short-horned）を意味し、双翅目の中でも触角が短いことを示しているGrimaldi and Engel (2005) p.515。
形態 触角は通常3節以下で構成され、最も先端の節には触角刺毛か触角筆突起を生じる。小顎鬚（maxillary pulps）は、カ亜目では通常3小節以上に分節するが、ハエ亜目の種はふつう2小節以下に分節する三枝（2008）p.274。
幼虫は蛆型で、脚はない。通常体節は12節以下で、体節が13節以上あるカ亜目の幼虫とは区別できる川合、谷田共編（2005）p.660素木（1969）p.87。気門は9対。
分類 ハエ亜目の単型性は、分子系統学的なデータや、形態的な特徴によって支持されているGrimaldi and Engel (2005) p.514。
伝統的な下位分類群として、直縫短角群（Orthorrhaphous、ハエ下目（環縫短角群）を除く下目を含む）、無額嚢節 Aschiza、額嚢節 Schizophora （ともにハエ下目内の分類群）などの群や節を設けることもあるが、これらは側系統群であると考えられている。
下位分類 ムシヒキアブ下目 - オドリバエ上科、ムシヒキアブ上科など。単型ではないためハエ下目に含めるとする研究もあるBRIAN M.WIEGMANN, DAVID K. YEATES, JEFFREY L. THORNE, and HIROHISA KISHINO 2003. Time Flies, a New Molecular Time-Scale for Brachyceran Fly Evolution Without a Clock. Systematic Biology 52(6):745-756DAVID K. YEATES 2002. Relationships of extant lower Brachycera (Diptera): a quantitative synthesis of morphological characters. Zoologica Scripta, 31(1) 105-121。 ハエ下目 - ヒツジバエ上科、ハナアブ上科など多数。 ミズアブ下目 - ミズアブ科など。 アブ下目 - アブ科など。 キアブ下目 - キアブ科など。
脚注
参考文献 David Grimaldi, Michael S. Engel (2005) Evolution of the Insects (Cambridge Evolution Series). Cambridge University Press 川合禎次、谷田一三（共編）『日本産水生昆虫―科・属・種への検索』（2005年、東海大学出版会） 三枝豊平 (2008)「ハエ目（双翅目）DIPTERA 概説」In, 平嶋義宏 森本桂 (監修)『新訂 原色昆虫大圖鑑』 Vol.III, 北隆館:東京, pp. 255-283. 素木得一 (1969)『幼虫の検索』北隆館.