山形県の二級水系一覧では、山形県を流れる水系のうち、山形県が管理する二級水系を記述する。2006年6月1日現在、17水系、59河川ある。

リストの順序は、北から南に、河口の位置を基準にして並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。

水系名河川延長(km)流域面積(km2)河川数河口所在地備考 月光川 17.400 11 遊佐町がっこうがわ 日向川 32.500 15遊佐町にっこうがわ 新井田川 15.100 6酒田市 （最上川） 229 7040 429酒田市一級水系 （赤川） 70 857 44酒田市一級水系 岡町川 0.750 1鶴岡市 油戸川 0.920 1鶴岡市 村上川 0.250 1鶴岡市 長者川 0.475 1鶴岡市 楯下川 0.660 1鶴岡市 三瀬川 4.631 4鶴岡市 天竜川 0.530 1鶴岡市 五十川 16.700 6鶴岡市いらがわ 温海川 15.800 3鶴岡市あつみがわ 庄内小国川 21.600 4鶴岡市 巌沢川 1.200 1鶴岡市 出口沢川 1.200 1鶴岡市 早田川 1.100 1鶴岡市わさだがわ 鼠ヶ関川 15.700 1鶴岡市

関連項目 河川 二級水系 日本の川一覧

出典・参考文献 日外アソシエーツ編集発行　『河川大事典』　日外アソシエーツ、1991年。 山形県土木部河川砂防課編集発行　『平成18年6月1日現在　山形県河川調書』　山形県、2006年。