Open Babel

Open Babelは自由ソフトウェアであり、主にを変換するために用いられる化学ツールである。情報学との関連が強いため、このプログラムはというよりはケモインフォマティクスに属するものといえる。Windows、UNIX、Linux、macOS、Androidで利用可能で、GNU GPL 2.0ライセンスのもとで配布されている。

このプロジェクトでは、「Open Babelが、クロスプラットフォームなプログラムとして、ユーザーと開発者をともに支援するコミュニティ指向の科学的プロジェクトとなり、ファイル形式とデータの内部変換を含む、化学、その他の多くの関連分野を支援するように設計されたライブラリとなる」ことを目標と掲げている。

歴史 Open Babelとはケモインフォマティクスライブラリから派生した。同様には、元の化学プログラム Babel と"OBabel"と呼ばれる非公開のオブジェクト指向ライブラリにあったアイディアを基本にしていた。

主な機能 110種以上のをサポート相互変換分子探索キラリティの検出分子の重ね合わせ R・C++・C#・Java・Perl・Python・Ruby・Scalaインターフェイス SMARTS記法を用いた部分構造フィルタリング分子動力学法による構造最適化水素原子の付加・削除フィンガープリント計算

脚注

参考文献 The Blue Obelisk-Interoperability in Chemical Informatics, Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner, and Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Model.; 2006;

Open Babel

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