パワプロクンポケット5は、2003年1月23日にコナミ（※）が発売したゲームボーイアドバンス用のゲームソフトである。パワプロクンポケットシリーズの5作目にあたる。 ※2006年3月31日の持株会社化に伴い、版権はコナミデジタルエンタテインメントに移っている。
本作は球場が4よりもさらに広くなる、新球種・キャンプ・『俺のペナント』モードの追加など野球部分の改善に力が入れられている。また、投球操作の変更・ミートカーソルを円形に変更することなどでパワプロに若干近づいたものとなっている。作成した選手はパスワードを使うことで実況パワフルプロ野球9決定版・実況パワフルプロ野球10（いずれもGC版）に移籍させることができる。
5の主な新要素・変更点 追加モード 俺のペナント サクセスで作った選手を使用して、ペナント戦を楽しんでさらに育成できるモード。パワプロ10から登場した『マイライフ』のパワポケ版といえる（ただしこちらのほうが先に出来ている）。1選手につき3年プレイ出来るが、サクセスと同様にリセットペナルティがあり、ペナルティとして1年分減らされる。パスワード入力による選手は使うことができない。 キャンプ 野球の練習ができるモード。練習内容は打撃、守備、総合攻撃、総合守備の4つの練習ができ、難しさを4段階で調節できる。
その他 ペナントモードに監督采配の要素が追加。 ペナント中の調子が100段階になった。 新しい特殊能力が追加されたが、一部の特殊能力がなくなった。 収録ミニゲーム サクセスモード中では従来のシリーズと異なり、グリグリおみくじを除いてレベル4をクリアするまで挑戦できる（1年目オフから2年目オフまで）。クリアするたびにレベルが上がり、レベル4をクリアすると特殊能力が獲得できる。 弾出る飛行機ぴゅんぴゅんぴゅん2 グラディウス風の横スクロールシューティングゲーム。大まかなルールは前作と同じ。今回は戦艦のコアを破壊し、その後自機を破壊されないことがクリアの条件となっている。レベルが上がると敵弾の数が増え、ボスの形態も増える。 グリグリおみくじ 大吉、吉、凶、大凶が書かれた盤面のルーレット（大凶が無い盤面もある）。サクセス中では1等、2等、3等、ハズレの盤面のくじ引きもある。ある程度の目押しが可能だが、くじの結果によって異なる確率でスベリが発生するので、大吉を確実に出すことはできない。レベルの設定はない。 ハコdeグチャッ 落ち物パズルゲーム。上から降ってくるブロックを押したり破壊したり（ゲーム開始時には破壊不可ブロックが2段敷き詰められている）して3つ並べるとブロックが消える。連鎖で消すと高得点だが、ブロックが消えてからもしばらく連鎖判定が残る。落下したブロックに潰されるか、画面上部まで積みあがると失敗。サクセス中ではレベル1で50秒、レベル2以上で1分間ゲームを続ければクリア。レベルが上がると落下するブロックの量が増える。ミニゲームとして遊ぶ場合は失敗するまでプレイするノーマルモードとサクセスと同じルールでプレイするサクセスモードがプレイできる。 見切ってシュシュしゅー 迅雷コーチが横切るタイミングを見計らって手裏剣を投げるゲーム。フェイントもある。迅雷コーチが飛び出す前に手裏剣を投げる・飛び出しても手裏剣を投げなかった、もしくは投げるのが遅かった場合はミス（見逃した場合にミスカウントが増えるのは前の回から1回も手裏剣を投げていない場合のみ）。3回ミスで縛られている凡田に手裏剣が当たり終了。サクセス中では30点でクリア。
表サクセス（モグラーズ編）
今回の物語の舞台はパワポケ2でも登場したモグラーズ。モグラーズ編2ということで、パワポケ2に登場した人物が出てくる。サクセス中の試合操作は打者は自分の打席、投手は主にランナー出塁時に操作するシステムになっている。
各章ごとに決められたノルマのパラメータを期限までに達成しなければゲームオーバーになってしまう。
あらすじ
1年目「俺はだれ？」 スター選手として活躍をしていた小杉は、ある事件により、モグラーズの万年二軍のお荷物選手（主人公）と入れ変わってしまう。主人公は小杉と交渉して元の身体を取り戻そうとするが、スター選手となった小杉は取り合わない。さらに凡田や水木から「実績も全然なく、最もクビに近い男」という自身の危機的状況を語られ、このままでは野球が出来なくなってしまうといわれた主人公は、まず実力をつけて1軍を目指す事にした。 2年目「これでいいのか？」 天才投手にして、オーナーの息子である大神がモグラーズに入団した。主人公は1軍に上がるべく北条監督へのアピールを始める。しかし、この頃から小杉がスランプに陥り成績が急降下する。さらにファンに対して暴力事件を起こし、謹慎処分となってしまい評判を落としていく。 3年目「大団円!?」 ペナントレース開幕から、主人公たちはリーグ優勝・日本一を目指す。この年は小杉の運命も左右する大切な時期となる。 モグラーズがリーグ優勝した後、日本シリーズでは練習を重ねて再び元の実力に戻った小杉の姿があった。
登場人物 大神グループ 大神モグラーズ/ドリルモグラーズ 主要人物 主人公（しゅじんこう） 元は小杉優作としてプロ野球の世界で活躍していたスター選手。しかし、球場の廊下で万年2軍のお荷物選手と体が入れ替わってしまう。当初は小杉時代の待遇を懐かしむ描写も多かったが、黒野の助言で練習を積み重ねて小杉に匹敵する実力をつけようとする。凡田を含むチームメイトからは終始事実を理解してもらえないままだった。 どのルートでも最終的に小杉としてではなく、主人公として生きて行く事になるパワポケの歴史（1～7）。 凡田 大介（ぼんだ だいすけ） 主人公とも仲の良いマニア。2以来、再び相棒キャラとして登場した。マニアショップや通信販売もよく利用する。自分のおもちゃのコレクションを集めた博物館を作ろうと考えている。2の時は一軍だったが、主人公が一軍に昇格するまでは二軍にいる。後のシリーズにもプロのOB選手として登場している。
チームメイト 水木 卓（みずき すぐる） 『パワポケ2』にも登場したモグラーズの選手。現在は半1軍的な存在だが、ドリルトーイの時代に一度一軍選手として優勝した経験があり、ファンからは人気がある。野球に関する本も沢山持っている。B級映画好きという点は変わらず、主人公にDVDの返却を要求するイベントがある。ポジションは二塁手。その後のシリーズでは引退しコーチになる。 馬井 遊二（うまい ゆうじ） 千葉ロッテマリーンズから6位指名を受けて入団。トレードにより、モグラーズに移籍した。ギャンブル好きで、入れ替わる前の主人公ともよく競馬場へ出かけていた。 うろつきイベントを進めておくと終盤に宝くじが当たって大金を手にするイベントが発生することがあり、エピローグでは引退して競馬の馬主になる。 諸星 須賀男（もろぼし すがお） パワーのみを評価されてモグラーズに入団した、入団二年目の新人選手。練習中にお菓子を食べることもあり、かなりの肥満体型になった（入団当時は100kgだった）。自分勝手でトラブルメーカーだが、選択肢によっては主人公に諌められて更生する。 8・11でもモグラーズ・ホッパーズの選手として登場し、11では選手会長となり、非常に落ち着いた性格になっている。 斎藤 勇（さいとう いさむ） 主人公と仲のよい後輩。トレーニングや買い物にもよく付き合っている。実力はあるが一軍と二軍を行き来している。安達美咲と付き合うことをきっかけに、登録名をイサムと改めた。 大神 博之（おおがみ ひろゆき） 『パワポケ4』から続いて登場したスーパールーキー。大神社長の息子で自球団に入れられた。デビュー当初はスランプに陥るが、主人公から様々な助言を受ける。チョコレートアレルギー体質は相変わらず。8、11にも登場。
関係者 古沢小一郎（ふるさわ しょういちろう） モグラーズの2軍監督。かつては選手だったが腰痛が悪化して引退した。主人公にアドバイスを送るなど、選手思いの監督。モグラーズ寮の寮長も兼任している。実家でトーテムポールを作っていることは変わらない。映像機器にハマっている様で、次々とより大画面のディスプレイに買い換えている。 北条 洋平（ほうじょう ようへい） モグラーズの1軍監督。監督としての手腕は低く、上にへつらい、目下の人間には辛く当たる横柄な性格。時折自棄になって、意味不明なことを口走るときもある。龍神パワーを信じており、グラウンドに池を作ったり、主人公に「龍神水」や「アルティメット龍神石Z」を勧めてくることも。年増のオバサンファンが多い（本人は若いエキスを求めている）。 鬼鮫 清次（おにざめ せいじ） モグラーズの筋力（打撃ではない）コーチ。迅雷コーチとよく喧嘩をしている。ちなみに一軍・二軍両方の選手のコーチを担当している（後の二人も同じ）。野球経験は特にないが、コーチとしての腕前は非常に高い。同性愛者で筋肉質の男を好みにしており、展開によっては主人公を襲ってくる（しかも、襲われた場合のルートではアルバムもある）。8、11にも登場しており、主人公を襲うのも相変わらず。 手久野 正巳（てくの まさみ） モグラーズの技術コーチ。ゲーム好きで、暇な時は「弾出る飛行機ぴゅんぴゅんぴゅん2」をやっている。バランスの取れた選手の方が好き。実は鬼鮫コーチと迅雷コーチの喧嘩の原因を作った人物であり、二人にその事がばれた際は半殺しの目に遭ったが、本人は罪悪感を全く感じておらず、いつもの事と笑顔で楽しそうに見ている。急に指導力と人望に優れるようになった主人公に、引退してコーチになれと勧めてくる。 迅雷 隼人（じんらい はやと） モグラーズの素早さ・変化球コーチ。いつも忍者の装束をつけている。鬼鮫コーチとはよく喧嘩をしている。因みに野球の経験は全くなく、新聞での募集に応募してたまたま採用されたらしい。 その正体は本作の#彼女候補の一人・埼川 珠子である。 荒井三兄弟（あらいさんきょうだい）/荒井 金男（あらい かねお）、荒井 銀次（あらい ぎんじ）、荒井 晴男（あらい ぱるお） シリーズの常連キャラ。2から引き続きモグラーズの球団職員として働いていて、内部の人間に厳しい。2年目の契約更改を担当する。趣味は抜き打ち検査で、装備アイテムを没収していくことがある（さおりちゃん人形を持っていると「チームメイトから苦情が入った」ということになり抜き打ち検査される確率が高まる）。 大神 美智男（おおがみ みちお） 大神グループ会長で大神モグラーズのオーナーで大神博之の父。息子をプロ入りさせるためドリルモグラーズを買収して大神モグラーズに改名させた。ドリルモグラーズの選手の様子を見るため、1年目の契約更改を自ら担当する。実は元プロペラ団でアメリカ本部の大幹部。
彼女候補 浅上 綾華（あさがみ あやか） 小杉のファンだが、その正体はプロペラ団の残党。プロペラ団の崩壊を信じていない。展開によっては小杉の命を奪う。 白木 恵理（しらき えり） 入れ替わる前の主人公の恋人。入れ替わる前の主人公とは良い思い出はなかったが一途に想っていた。そのため、主人公の不自然な言動から入れ替わりに気づき、ひどく悩む。 見かけや言動から幼く見えるが、実は27歳で水商売を勤めている。 星野 めぐみ（ほしの めぐみ） ファミレスでバイトをしている女の子。ストーカーに悩んでおり、解決できるかで彼女の運命が変わる。緑髪の彼女候補で、後の作品における「緑髪彼女はイベントが多い」という設定のきっかけになっている。ただし、パワポケ6の蕪崎詩乃と同じく博多幸博の書いたストーリーではない。 埼川 珠子（さいがわ たまこ） 路地裏で占いをしている。28歳。愛称は「占いタマちゃん」。本人は占いを信じておらず、自分の占いが当たっているのかさえ分かっていない。 珠子というのは偽名であり、本名は「鈴霞（すずか）」である。また抜け忍でもあり、迅雷コーチとしてモグラーズに出入りしていた。 安達 美咲（あだち みさき） 大学生。実家が旅館を経営している。イベントの進め方によっては勇とつき合う事もある。 倉刈 日出子（くらがり ひでこ） 倉刈仁志の娘であり明の姉。「2」と「3」にも登場していたが今回は彼女候補になった。重なる借金のためほとんどの日をバイトに費やしており、主人公と会える日は限られている。「8」「11」にも再登場し、「11」では再び彼女候補の一人として登場。 西湖 美友（さいこ みゆ） 外れ彼女候補。「三つのNO」を信条とする大学生。1や2に登場した荒井紀香と同じようなタイプのキャラで、話しかけるといきなり彼女になる（強制的に彼女になる場合もある）。そのため、他の彼女の攻略中に現れてしまうとそちらの彼女が攻略不可能になってしまう。
その他 小杉 優作（こすぎ ゆうさく） 主人公の元の体。モグラーズの万年二軍のお荷物選手で、選手としての能力は非常に低かった。2軍選手だったころから裏では「自分には野球しかない」とこぼしていたわりには、生活態度は不真面目であり、何の苦労もせずに手に入れた小杉の能力におぼれていた。改心して猛練習を始めるか、入れ替わる前より落ちぶれていくかは主人公の活躍にかかっている（試合での勝利数が3勝以上であれば改心する）。改心した場合は塚本と手を切り練習に励むが、勝利数が1～2勝の場合は展開こそ異なるが事故によって再び元の体に入れ替わるも塚本によってアフリカの傭兵部隊に売り飛ばされ、0勝の場合はプロ野球界から失踪し塚本の紹介で海外へ逃げ出すことになる。 塚本 甚八（つかもと じんぱち） 入れ替わる前の主人公の悪友。「きししし」と笑う。裏の世界にも割と顔が利く。小杉の入れ替わりにいち早く気づき、彼につきまとう。その一方で、面倒見が良い一面もある。3年目の展開によっては元の姿に戻った小杉を傭兵部隊に売り飛ばすが、失踪した展開では「惨めすぎて騙す気にもならない」として小杉に海外での仕事を手配する。 今田 勝蔵（いまだ かつぞう） 「2」から引き続き登場。親子二代に渡るモグラーズの熱狂的なファンで、モグラーズ私設応援団長。かつての優勝もあってか現在は応援団の団員が増えた様子。実家は中華料理店を営んでいる。 黒野 鉄斎（くろの てっさい） 「4」から引き続き登場。「3」のネオプロペラ団アジトの跡で、立花やたかゆきとともに怪しい研究をしている。3年目の展開によっては小杉の姿に入れ替わった主人公を元の姿に戻す。 立花 ボボ（たちばな ボボ） 「3」にも登場したバッタ人間。 たかゆき 「3」にも登場したロボット。機械扱いされることを嫌い、自らを人間と言い張る。自分の芸に限界を感じている。子供たちに野球を教えることもある。 アルベルト・安生・アズナブル（アルベルト・あんじょう・アズナブル） シリーズ常連の外国人。「オリンピックのアスリート」を自称する。毎度の如く野球のコーチをするも、当然骨折する。イベントを進めると主人公の専属コーチになってしまい部屋に住み着いた上、他の選手とも顔なじみになる。 磯田 修一（いそだ しゅういち） 元モグラーズの2軍コーチ。プロペラ団のモグラーズ買収に伴い辞職し、凡田の影響でマニアショップを開業する。かつて主人公を指導したこともあると語る。 倉刈 仁志（くらがり ひとし） 元モグラーズの選手で、火星オクトパスに所属していたが、今作で野球を引退した。火星オクトパスの垣内に紹介された仕事は失敗した上、他人の保証人になり、さらに借金を抱えることになる。6や11にも登場する。 倉刈 明（くらがり あきら） 倉刈仁志の息子。おもちゃは遊ぶものだと考えているため、凡田とは対立関係にある。7では高校生となっており、8ではモグラーズの後継球団であるホッパーズに選手として入団する。 本山 遊馬（もとやま ゆうま） 通称「ゆうまくん」。サイキッカーであり、レア物を見つける能力でマニアの間では有名。凡田を「だいすけくん」と呼ぶほど仲がいい。モグラーズに入団する予定だったが記憶喪失になる。 山口 幸恵（やまぐち ゆきえ） モグラーズの近くで小料理店を営んでいる。「2」では彼女候補だった。 大鉄（だいてつ） 「2」の主人公の兄。かつては裏稼業に手を染めていたが、現在は更生して幸恵の小料理店で働いている。彼女との関係は不明。 大橋 吉江（おおはし よしえ） パチンコ屋の常連客でありラーメン屋の店員であり、倉刈家のおとなりさん。北条監督のファンかと思いきや、その北条監督に「吉江様」と呼ばれたりする謎の人である。 ソムシー タイ人の女性。恵理とは親友で同じ職場の仲間。最近上手くいっていない主人公と恵理の仲を取り持とうとする友達思いだが、ややズレたところがある。 大谷 健（おおたに たけし） 新聞記者。大神 博之の取材で登場。本作では『1』『3』と比べ、肌が色黒で顔が縦に長い老け顔で完全な端役で登場。展開によって終盤でも登場。正義感が強い気骨がある人物だが、小杉が発奮してチームを優勝に導き、大神モグラーズが優勝を逃し落ち込んでいる小杉を取材している際に大神モグラーズを「万年Bクラス」と馬鹿にする一面を見せる。その結果大谷は小杉に殴られ、小杉は日本シリーズに出られなくなった。野球テストのチュートリアルでの解説役も務める。 平田 ヤス（ひらた やす） ひでこの通う高校の教師。日の出高校で働いていたが、転勤してきた。 亀田 光男（かめだ みつお） 『1』『2』『3』で登場したメガネ一族の1人。綾華のイベントで登場する。今作ではサングラスをかけスーツ姿となっている。 ファミレス店長（ファミレスてんちょう） めぐみがバイトしているファミリーレストラン店長。一見普通の人だが、ある秘密を持つ。 おばちゃん 北条監督の追っかけとして登場するおばさん。外見は肌が若干色黒なのが特徴。『3』のおばちゃんの親戚。 さおりちゃんフィギュア 彼女候補ではないが、電話コマンドで話すことによりやる気とステータスを回復させることができる。「抜き打ち検査」と称した荒井三兄弟による部屋内の検査で没収されることもある。
上記のキャラのほか、リーグ優勝決定戦と日本シリーズ時のみ、『パワプロ5』から猪狩守、戸井鉄男、『1』から三鷹光一、『2』から小角雄二が相手チームの選手として登場する（なお『11』の公式FAQから、小角雄二以外の選手は『11』の時点には既に引退と明言された）。
作中用語 大神グループ 元プロペラ団の幹部であった大神美智男が、プロペラ団解体後その主要な部分をまとめあげ、ネット金融を中心にのしあがった巨大グループ。プロペラ団の手を離れたモグラーズを買収して新たなオーナーとなった。後の作品にも多大な影響を与えるグループである。
裏サクセス（忍者戦国編） シミュレーションゲーム仕立てのサクセスモード。今回もパワポケ4同様、野球人形を作ってお金で能力アップしていく方式である。前作と同様に、本家パワプロに登場した選手をサクセス選手として登録することが出来る。今作から裏サクセスの主人公が違う衣装で登場するようになった。また、この裏サクセスから背景が拡大し、キャラに白い縁取りがされるようになった（この仕様は後の『6』以降の表サクセスに逆輸入された）。今回はゲーム開始時に特徴の異なる3つの里があり、選んだ里によって仲間になるキャラやストーリーなどが変化するようになっており、裏サクセスで異なるシナリオが選べる最初の作品である。クリア条件は120日目までに本拠地の城を落とされずに3つの珠を集めること。
あらすじ
まだ日本が色々な国に分かれていた時代。その中のある国のお姫様が「野球をする人形、野球人形とやらが見てみたい」と言い出した。困った大名は人形を手に入れるため忍者を使うことを決め、忍者の国である「風賀の国」に依頼書を携えた3つ子の使いを出した。しかし道すがら、彼らは些細なことで喧嘩を始めてしまい、それぞれが「水虎」「火竜」「月光」の3つの里に依頼書を届けてしまう。程なく3つの里の頭領達はその事に気づき激昂、3つの里は野球人形作成の任務完遂と自分たちの里の威信を賭け、壮絶な戦争をすることになった。
紆余曲折の末、主人公は野球人形を完成させ大名の城へと運ぶ。ところが、中立勢力とみなされれていた妖怪軍団の首領・亀田幻妖斎が城を襲撃する。彼は主人公たちの前で自分の正体を明かした後、自身の目的が珠の回収であることを語り、Zガンダーゴーレムで戦いを挑んでくる。戦いのどさくさにまぎれ、幻妖斎は野球人形の回収に成功するも、主人公が用意した爆弾付きの偽物をつかまされてしまう。そして、本物の人形は別働隊によって無事に大名の下へ届けられた。
勢力 ゲーム開始時に水虎、火竜、月光の3つの里の中から1つ選んでプレイすることになる。選んだ里により物語と仲間になる人物や開始時の領地の数などが変化してシナリオが異なる。この3つの里に加え、中立勢力として妖怪の勢力が存在する。 水虎 頭領は教頭斎。 最初から選択できる里で、初心者向けの陣営として位置付けられている。 初期の仲間は外藤のみだが、根呂と平山と村上をすぐ仲間に出来る。 火竜 頭領は任月。 水虎より高い難易度の陣営として位置づけられている。 領地に重税を課しているという設定のため、たまに領地の反乱を鎮圧することになるイベントが発生する（失敗すると妖怪の領地になる）。 月光 頭領は野々村。3つの里の中で最も高い難易度の陣営として位置づけられている。 妖怪軍団 頭領は亀田幻妖斎。メインカラー灰色。 共通の敵対勢力であり、初期勢力としては選択不可能。初期状態では里の3分の1程度を制圧している。 風賀のあちこちに存在する妖怪を取り纏める勢力だが、上層部である妖怪四天王は全員人間である。
ゲームシステム プレイヤーは妖怪を除く3つの里から所属を決める。各村などをうろついて仲間を見つけ（モブキャラに当たる下忍はコマンドで雇用する）、各領地に攻め込み勝利することで陣地を広げる。戦闘はパワポケ4と同様のコマンド式。1日が終わると自軍の勢力から領地収入が入り、賃金を払う。賃金が払えない場合を除き仲間キャラのHP・MPが回復する。と同時に敵も回復する（ただし、味方よりも回復量は少ない）。 戦闘では敵が全員逃げるか倒されると勝利となり、攻めている場合は領地を獲得する。全員が逃げるか死亡する（HPが0になる）、もしくは主人公のHPが0になると敗北。攻められている場合は領地を失う。城を攻め落とすとその勢力の領地をすべて入手する。野球人形献上直前の最終決戦に敗北してもペナルティはなく、勝てば能力パーツが手に入る。 経験値は攻め込んだ者のうち、逃亡者を含めた生存者で分配される。主人公のHPが0になるとペナルティとして「主人公のレベル×100両」の所持金が失われるが、本拠地で倒された場合を除きゲームオーバーにはならない。主人公以外のキャラは死亡しても復活はできないが、同種の下忍は再雇用できる。 妖怪（中立）以外の勢力の領地が本拠地の城と連結されずに分断された場合、分断された領地は妖怪が支配する中立地になる。 主人公含め各キャラの最高レベルは30。主人公にも術を使うためのMPが設定された。レベル16になると術、妖術（前作の魔法）が全体攻撃になる（敵が2人以上残っている場合のみ）。 様々な能力補正がある。 各キャラクターには得意な地形が設定されている場合があり、得意な地形では3レベル分能力が上昇する（HPだけは例外）。町および城では、レベル分防御側の能力が上昇する。関所でも防御側全キャラの能力が4レベル分上昇する。 軍師（三鷹か服部）を雇っていると、能力に1レベル分のボーナスが加わる。これは軍師を戦闘に出さなくても加わる（作中でも三鷹と服部に説明される）。 主人公は得意な地形の設定はないが、同様の効果を得られるアイテムが存在する。 仲間は主人公含めて12人まで加えられる。クビもできるが、下忍以外を解雇すると次の戦闘で敵として登場する。仲間キャラは通常の敵に比べ倒した際に入手できる金額が多いため、不要な仲間を即座に解雇して敵にし、軍資金にするという手段もある。 敵キャラにもレベルが設定されており、各領地の敵は一部を除き最初に攻め込んだ時の主人公のレベルに依存する。そのため、町や塔などの強敵が守る場所はレベルの低い時に偵察隊を送り込み、レベルを上げてから攻め込む方法が有効であると外藤がゲーム内で語る。
登場人物 登場人物の名前か、振仮名後の括弧書きの名前が表サクセスでの登場人物の本名で、括弧書きの数字が本作まで登場した登場人物の表サクセスの登場作品で未表記はオリジナル。
主要人物 主人公（しゅじんこう） 本作の主人公。前作では表サクセスの使い回しだったが、本作以降は裏サクセス用の立ち絵が用意されるようになった。里の頭領から野球人形の作成を命じられる。全権を委ねられており、忍者の雇用や解任も行える。最初に選んだ勢力に所属する忍者で、里ごとに服の色が各勢力のメインカラーに変わるほか、使える術は里によって変化する（水虎だと「水遁の術」、火竜だと「火遁の術」、月光だと「かまいたちの術」になる）。 凡田（ぼんだ）【凡田 大介（ぼんだ だいすけ）：『2』『5』】 主人公の会計係として同行する忍者。戦闘能力は極めて低いため戦闘には参加しない。主人公と違い、服の色は薄紫で固定。 教頭斎（きょうとうさい）【教頭先生（きょうとうせんせい）：『1』】 水虎の頭領。女言葉で喋る。火竜と月光では攻め込むと、カラクリの極悪戦車に乗って登場する。 水虎でゲームを始めた場合、水虎城をうろつくとゲームの解説を行ってくれたりと割と面倒見が良いが、他の勢力では私利私欲で部下を殺害する。 任月（にんげつ）【任月 高志（にんげつ たかし）：『2』】 火竜の頭領。息子のカケルを大事にしており、「下忍は消耗品」と言うなど、人望はあまりない。水虎と月光では攻め込むと、秘密兵器である竜に乗って登場。 カケル【任月 駆（にんげつ かける）：『2』】 任月の息子で、火竜の跡継ぎとして育てられている。城の外に出してもらえず、主人公に様々なもの（カブトムシやカエル等）を持ってくるよう頼む。 野々村（ののむら）【野々村 耕造（ののむら こうぞう）：『2』】 月光の頭領。他の頭領とは違いまともな性格をしており部下の人望は厚い。頭領でありながら内職を行っている。水虎と火竜で攻め込むと部下の影忍と月忍を引き連れ登場する。風賀の国の里の頭領の中では唯一生身で戦闘を行う。
仲間 外藤（がいどう）【外藤 狭二（がいどう きょうじ）：『1』『2』『3』】 水虎の中忍頭。水虎では主人公の下につくことになり、初めから仲間になる。他の里で始めた場合は仲間にはできず、水虎城を攻め込むと主人公たちの前で教頭斎に身代わりとして殺される。 愛（あい）【野々村 愛（ののむら あい）：『2』】 月光の当主、野々村の娘。他陣営で始めても水木の面会に応じれば仲間にすることができるが、その場合は主人公たちがいないうちに当主を倒そうと考えている（面会を断った場合は混乱に乗じて主人公の命を狙ってくる）。 倉刈（くらがり）【倉刈 仁志（くらがり ひとし）：『2』『3』『5』】 月光の初期メンバーで、火竜のいろは村から逃げてきた過去を持つ。 他陣営でのシナリオでは、イベントで水木に殺されるか、敵として登場する。 水木（みずき）【水木 卓（みずき すぐる）：『2』『5』】 月光の初期メンバーで、月光のためというよりは、好意を持っている愛のために働いている。 他陣営でのシナリオでは、仇討ちを狙う愛のために「月光の財宝が目当てだった」という理由で倉刈を殺害して愛を主人公に売り、裏切り者の汚名を被り何処かへ消える。なお、面会を断った場合は飲み込んでいた爆弾で自爆して果てる。 根呂（ねろ）（ネロ：『1』『3』） はまぐり村の訓練所にいる忍者の見習い。怪力が自慢だが、頭が悪い。 水虎の場合は実践で学ばせるために引き取る形で仲間にできる。他陣営のシナリオでは、はまぐり村が占領された後も訓練所に一人取り残されており仲間にできるが、「訓練所は移動した」と騙して追い払った場合は仲間に出来ない代わりに高価なパーツをくれる。また、展開によっては曽根村と刺し違えたり、ハガネと意気投合することもある。 ハガネ【鋼 毅（はがね つよし）：『1』『3』】