キム・ビンネリ(、1969年6月18日 - )は、大韓民国の生化学者、分子生物学者。学術論文ではV. Narry Kimと表記される。マイクロRNA(miRNA)の生合成経路とRNAの3′末端修飾(RNAテーリング)の研究で知られ、ソウル大学校生命科学部特別教授(Distinguished Professor)、(IBS)RNA研究団長を務める。
miRNAが細胞内で段階的に作られる経路を示し、その中核因子であるDROSHA、DGCR8、LIN28、末端ウリジルトランスフェラーゼなどの働きを解明した。また、mRNA末端を網羅的に解析するTAIL-seqを開発し、ポリ(A)鎖の塩基組成がmRNAの安定性を制御することを示した。2021年に王立協会外国人会員に選出された。 サムネイル|2024年に開催された会議で講演するキム・ビンネリ 経歴 1969年、全羅南道霊光郡に生まれた。ソウル大学校で微生物学を学び、1992年に学士、1994年に修士の学位を取得した。オックスフォード大学ではレトロウイルスを利用した遺伝子導入を研究し、1998年に生化学の博士号を取得した。
1999年から2001年まで、ペンシルベニア大学のハワード・ヒューズ医学研究所で博士研究員を務め、ギデオン・ドレイファスの研究室でmRNA監視機構を研究した。2001年に韓国へ戻り、ソウル大学校で独立研究室を立ち上げた。同大学で研究助教授(2001年 - 2004年)、助教授(2004年 - 2008年)、准教授(2008年 - 2013年)、教授(2013年 - )を経て、2017年に特別教授となった。2012年にはIBS RNA研究団の創設団長に就任した。
研究 マイクロRNAの生合成 miRNAは、標的となるmRNAの分解や翻訳抑制を通じて遺伝子発現を調節する短いノンコーディングRNAである。キムの研究グループは2002年、一次転写産物であるpri-miRNAが核内でpre-miRNAへ加工され、細胞質へ移動したのち成熟miRNAになるという段階的な生成過程を示した。2003年には、核内のRNase III酵素DROSHAがpri-miRNAの切断を開始することを明らかにした。続いて、miRNA遺伝子の多くがRNAポリメラーゼIIによって転写されること、DROSHAとDGCR8がマイクロプロセッサー複合体を形成することを報告した。
2006年には、DROSHA-DGCR8複合体がpri-miRNAの構造を識別して切断位置を決める分子基盤を示した。2015年にヒト・マイクロプロセッサーの機能構成を解析し、2016年にはヒトDROSHAの立体構造を決定した。
miRNAの量を調節する仕組みについても研究し、2008年にRNA結合タンパク質LIN28がlet-7前駆体の3′末端にウリジン付加を誘導し、Dicerによる成熟を妨げることを示した。翌年には、この反応を担う酵素TUT4を同定した。これらは、幹細胞性や腫瘍形成に関係するLIN28-let-7制御系の理解につながった。
細胞質側の加工酵素Dicerについては、2011年にRNAの5′末端を認識して切断精度を保つ機構を報告した。2023年には、Dicerが前駆体内部の配列を読み取って切断位置を決めることと、切断中のヒトDicer-pre-miRNA複合体のクライオ電子顕微鏡構造を、2編の論文で報告した。2026年には、HSP90とp23がRNAを結合していないArgonauteを保持し、二本鎖小RNAの取り込みとRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)の組み立てを導く構造機構を共同研究で明らかにした。
RNAの末端修飾 miRNA研究から発展して、キムはmRNAを含むRNAの3′末端に塩基が付加される「RNAテーリング」の機能を研究した。2014年、mRNAのポリ(A)鎖長と末端塩基をゲノム規模で測定するTAIL-seqを開発し、mRNA末端ではウリジル化やグアニル化が広く起きていることを示した。同年にはTUT4とTUT7が短いポリ(A)鎖をもつmRNAをウリジル化し、分解の目印を付けることを報告した。
2018年には、末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼTENT4AとTENT4Bがポリ(A)鎖にグアノシンなどを織り交ぜた「混合テール」を作り、それが脱アデニル化を遅らせてmRNAを安定化することを示した。この研究は、ポリ(A)鎖をアデノシンだけの単純な鎖とみなす従来像を改め、鎖長だけでなく塩基組成も遺伝子発現を調節することを示したものと評価されている。
ウイルスRNAとRNA医薬 2020年、キムらはSARSコロナウイルス2の転写産物とRNA修飾を高解像度で解析し、ゲノムRNAとサブゲノムRNAからなる転写産物群の構造を示した。同年、B型肝炎ウイルスとヒトサイトメガロウイルスがTENT4-ZCCHC14複合体を利用してRNAに混合テールを付加し、分解から保護する機構を報告した。
2023年には、143種のウイルスに由来する3万367個の配列断片を細胞内で機能スクリーニングし、RNAの安定性・局在・翻訳を変える調節配列を探索する「機能的ウイロミクス」を提案した。この手法を拡張した2025年の研究では、19万6277個のウイルス配列からmRNAの安定性と翻訳を高める11個の配列要素を同定し、塩基修飾mRNAへの応用可能性を示した。
また2025年、脂質ナノ粒子で送達された外来mRNAを細胞が取り込み、細胞質へ放出し、分解する過程をゲノム規模のCRISPRノックアウトスクリーニングで解析した。ヘパラン硫酸プロテオグリカンとV-ATPaseが取り込みとエンドソーム脱出に関与し、TRIM25が酸性環境を感知して外来mRNAの分解を促すこと、N1-メチルシュードウリジン修飾がTRIM25による認識を弱めることを示した。
学術団体 2013年に欧州分子生物学機構(EMBO)外国会員、2014年に韓国科学技術翰林院正会員および米国科学アカデミー外国人会員に選出された。2021年には王立協会外国人会員に選ばれ、生化学工学者のイ・サンヨプ(Sang Yup Lee)とともに、韓国から初めて選出された外国人会員となった。
受賞歴 2007年 - 大韓民国「今年の女性科学技術者賞」、韓国科学技術翰林院若手科学者賞 2008年 - ロレアル-ユネスコ女性科学賞(アジア太平洋地域) 2009年 - 湖巌賞医学部門 2010年 - 大韓民国国家科学者 2013年 - 大韓民国最高科学技術人賞 2017年 - ヒトゲノム機構陳賞(Chen Award for Distinguished Academic Achievement) 2019年 - アサン医学賞基礎医学部門 2024年 - 第3回イム・ソンギ研究者賞大賞 2025年 - 韓国分子・細胞生物学会生命科学賞 2026年 - 科学技術勲章・創造章(1等級) 2027年 - HFSP中曽根賞受賞者に選出(アジアの研究者として初)
脚注
外部リンク Narry Kim Lab - 公式研究室サイト Kim, V. Narry - ソウル大学校生命科学部 Professor Narry Kim FRS - 王立協会