Heininen on muun muassa seuraavien henkilöiden sukunimi:
Eeva-Maria Heininen (s. 2003), salibandyn pelaaja Juho Heininen (1880–1964), kirkkoherra Kaarlo Heininen (ent. Wallenström, 1853–1926), kansanedustaja Lassi Heininen, arktisen alueen, geopolitiikan ja ilmastonmuutoksen tutkija ja professori Minnie Heininen (s. 2001), salibandymaalivahti Paavo Heininen (1938–2022), säveltäjä, pianisti ja professori Ruusu Heininen (1876–1962), opettaja ja lastenkirjailija Simo Heininen (s. 1943), historioitsija.