Ketjuisomeriassa eli runkoisomeriassa molekyylien hiilirunko on erilainen. Esimerkiksi pentaanilla on kolme isomeeria, (n-)pentaani, isopentaani (metyylibutaani) ja neopentaani (dimetyylipropaani).

Pentaanin isomeerit (n-)pentaani isopentaani neopentaani

Luokka:Isomeria