Pyhän Johanneksen kirkko on useiden kirkkojen nimi:
Pyhän Johanneksen kirkko eli Männistön kirkko, vuonna 1992 käyttöön vihitty kirkko Kuopiossa Pyhän Johanneksen kirkko, vuonna 1907 käyttöön vihitty kirkko Malmössä Pyhän Johanneksen kirkko, vuonna 1867 käyttöön vihitty kirkko Tallinnassa Pyhän Johanneksen kirkko, vuonna 1890 käyttöön vihitty kirkko Tukholmassa Pyhän Johanneksen kirkko, kirkko Lythamissa, Englannissa Pyhän Johanneksen kirkko, kirkko Skópeloksen saarella Kreikassa Pyhän Johanneksen kirkko, kirkko Stavangerissa, Norjassa
Pyhän Johanneksen basilika, myöhäisantiikin aikainen kirkko Vähässä-Aasiassa lähellä Efesosta
Katso myös
Johanneksen kirkko, usean kirkon nimi Çeşmen kirkko, Johannes Kastajalle pyhitetty kirkkorakennus Pietarissa
nl:Iglesia de San Juan de Dios