EHF Champions League 1998-99 for mænd var den sjette EHF Champions League-turnering for mænd. Turneringen blev arrangeret af European Handball Federation og havde deltagelse af 33 hold. Holdene spillede først to cup-runder (1/32- og 1/16-finaler). De seksten vindere af 1/16-finalerne gik videre til gruppespillet, der bestod af fire grupper med fire hold, hvorfra de fire vindere og fire toere gik videre til kvartfinalerne.
Turneringen blev for fjerde år i træk vundet af FC Barcelona fra Spanien, som i en gentagelse af de forrige to års finaler over to kampe samlet vandt 51-40 over kroatiske Badel 1862 Zagreb. Det danske mesterhold, GOG, repræsenterede Danmark i turneringen og formåede at kvalificere sig til gruppespillet, hvor holdet endte på tredjepladsen i gruppe C.
Resultater 1/32-finaler
{| class="wikitable" style="text-align:center;" ! colspan="2"|Dato ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 1. kamp ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 2. kamp ! colspan="3"|Resultat |- ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|Samlet
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
1/16-finaler
{| class="wikitable" style="text-align:center;" ! colspan="2"|Dato ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 1. kamp ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 2. kamp ! colspan="3"|Resultat |- ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|Samlet
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
Gruppespil
Gruppe A
DatoKampRes. HoldKampeMålPoint20px| 20px| 20px| 20px|
Gruppe B
DatoKampRes. HoldKampeMålPoint20px| 20px| 20px| 20px|
Gruppe C
DatoKampRes. HoldKampeMålPoint20px| 20px| 20px| 20px|
Gruppe D
DatoKampRes. HoldKampeMålPoint20px| 20px| 20px| 20px|
Kvartfinaler
{| class="wikitable" style="text-align:center;" ! colspan="2"|Dato ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 1. kamp ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 2. kamp ! colspan="3"|Resultat |- ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|Samlet
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
Semifinaler
{| class="wikitable" style="text-align:center;" ! colspan="2"|Dato ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 1. kamp ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 2. kamp ! colspan="3"|Resultat |- ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|Samlet
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
Finale
{| class="wikitable" style="text-align:center;" ! colspan="2"|Dato ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 1. kamp ! rowspan="2" width="200px"|Hjemmehold i 2. kamp ! colspan="3"|Resultat |- ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|1. kamp ! width="50px"|2. kamp ! width="50px"|Samlet
| align="left"|20px| | align="left"|20px|
Kategori:Håndbold i 1998 Kategori:Håndbold i 1999 Kategori:Sæsoner i EHF Champions League