thumb | right | Escherichia coli er en gram-negativ prokaryotisk model organisme. thumb | Drosophila melanogaster er en af de mest kendte organismer der benyttes til genetiske eksperimenter. thumb | Saccharomyces cerevisiae er en af de mest studerede eukaryotiske modelorganismer i molekylær- og cellebiologien.
En modelorganisme er en ikke-menneskelig art, der studeres grundigt for at forstå bestemte biologiske fænomener med forventning om, at opdagelser gjort i modelorganismen vil give indsigt i, hvordan andre organismer fungerer. Griffiths, E. C. (2010) What is a model? Modelorganismer bruges i vid udstrækning til at undersøge menneskelige sygdomme, når menneskelige eksperimenter ville være umulige eller uetiske at udføre. Denne strategi muliggøres af den fælles afstamning af alle levende organismer og bevarelsen af metaboliske og udviklingsmæssige processer og det genetiske materiale i løbet af evolutionen.
E. coli Der er mange modelorganismer. Et af de første modelsystemer inden for molekylærbiologien var bakterien Escherichia coli, en almindelig bestanddel af det menneskelige fordøjelsessystem. Flere af de bakterievira (bakteriofag), der inficerer E. coli har også været meget nyttige til undersøgelse af genstrukturer og genregulering (f.eks. fager som Lambdafag og Escherichia coli virus T4). Det diskuteres imidlertid, om bakteriofager skal klassificeres som organismer, fordi de mangler stofskifte og er afhængige af værtscellernes funktioner til formering.
Udvalgte modelorganismer Organismerne nedenfor er blevet modelorganismer, fordi de muliggør studiet af bestemte karakteristikker eller på grund af deres genetiske tilgængelighed. For eksempel var E. coli en af de første organismer, for hvilken genetiske teknikker transformation eller genetisk manipulation blev udviklet for.
For alle disse modelorganismer er deres genomer blevet sekventeret, inklusive deres mitokondrie-/kloroplast-genomer. Disse sekventerings-data findes i modelorganismedatabaser for at give forskere en portal, hvorfra de kan downloade sekvenser (DNA, RNA eller protein) eller for at få adgang til funktionel information om specifikke gener, for eksempel den subcellulære lokalisering af genproduktet eller dets fysiologiske rolle i organismen.
Modelorganisme Dansk navn Uformel klassifikation Anvendelse (eksempler) VirusPhi X 174ΦX174Virusevolution Prokaryot Escherichia coliE. coli Bakteriebakteriel genetik, metabolisme Eukaryot, encellet Dictyostelium discoideum Amøbe immunologi, interaktioner mellem vært og patogen Saccharomyces cerevisiae ØlgærBagegør Gærsvampcelledeling, organeller, osv. Schizosaccharomyces pombe Gærsvamp cellens cyklus, cytokinese, kromosombiologi, telomerer, DNA metabolism, organiseringen af cytoskelettet, industriel anvendelseFission Yeast GO slim terms | PomBase Chlamydomonas reinhardtii Algehydrogenproduktion Tetrahymena thermophila, T. pyriformis Ciliatundervisning, biomedicinsk forskning Emiliania huxleyi Planktonhavoverfladens temperatur Plante Arabidopsis thaliana Almindelig gåsemad Dækfrøet plantepopulationsgenetik Physcomitrella patens Bulet muddermos Mos bioteknologi Decker EL, Reski R (2007) Moss bioreactors producing improved biopharmaceuticals ‘’Current Opinion in Biotechnology. 18:393-398.’’ Populus trichocarpa Vestamerikanst Balsampoppel Trætørketolerence, ligninbiosyntese, veddannelse, plantebiologi, morfologi, genetik, and økologi Dyr, hvirvelløse Caenorhabditis elegansNematode, rundorm Ormdifferentiering, udvikling Drosophila melanogaster Bananflue Insektudviklingsbiologi, parkinsons sygdom hos mennesker Callosobruchus maculatus Insektudviklingsbiologi Dyr, Hvirvel- Danio rerio Zebrafisk Fiskembryonisk udvikling Fundulus heteroclitus Fisk hormoners effekt på adfærdNon-Mammalian Hormone-Behavior Systems https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/fundulus-heteroclitus Nothobranchius furzeri Fiskaldring, sygdom, evolution Oryzias latipes Fiskfiskebiologi, kønsbestemmelse Anolis carolinensis Grøn anole Reptilreptilbiologi, evolution Mus musculus Husmus Pattedyrsygdomsmodeller hos mennesker Gallus gallus Bankivahøne Fuglembryonisk udvikling og organogenese Taeniopygia castanotis Zebrafinke Fugl stemmeindlæring, neurobiologi Xenopus laevisXenopus tropicalis Afrikansk sporefrøLille sporefrø Paddeembryonisk udvikling
Referencer
Kategori:Farmakologi Kategori:Biokemi