En haplogruppe (fra , haploûs, "enkel eller simpel") er en kombination af alleler på forskellige kromosomområder, som er tæt forbundne og har tendens til at blive nedarvet sammen. Det er en gruppe af individuelle organismer, som indenfor molekylær evolution, deler en fælles afstamning – en genetisk linje af afstamning dokumenteret med bestemte enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) mutationer. Eftersom at haplogrupper består af lignende haplotyper, så er det typisk muligt at forudsige et tilhørsforhold til en haplogruppe ud fra haplotyper.
Haplogrupper vedrører en enkelt slægtslinje, som typisk kan dateres tusinde af år tilbage i tiden. Et sådant tilhørsforhold til en haplogruppe består for alle individer af en relativt lille mængde arvemasse i de enkelte individer.
Hver haplogruppe stammer fra og forbliver en del af en foregående enkelt haplogruppe (eller paragruppe). Det betyder, at hver relateret gruppe af haplogrupper kan modelleres præcist hierarkisk.
Haplogrupper identificeres normalt af begyndelsesbogstaver fra alfabetet og detailforbedringer består af tillæg af tal- og bogstavkombinationer (eksempelvis A → A1 → A1a).
Indenfor humangenetik er de mest studerede haplogrupper Y-kromosom (Y-DNA) haplogrupper og mitokondrie DNA (mtDNA) haplogrupper, som begge kan benyttes til at definere genetiske populationer. Y-DNA nedarves udelukkende fra far til søn, hvor mtDNA nedarves fra mor til børn af begge køn. Ingen rekombination og således er Y-DNA og mtDNA forandringer udelukkende defineret ud fra mutationer og ikke sammenblanding af forældrenes arvemasse.
Referencer
Eksterne henvisninger
Generelle World Families Network The Genographic Project
Alle DNA-haplogrupper Y-Chromosome - *http://www.scs.uiuc.edu/~mcdonald/WorldHaplogroupsMaps.pdf
Y-kromosom DNA-haplogrupper Y Chromosome Consortium ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree PhyloTree's Y-tree A minimal reference phylogeny for the human Y-chromosome DNA Heritage's Y-haplogroup map Haplogroup Predictor The Y Chromosome Consortium (2002), A Nomenclature System for the Tree of Human Y-Chromosomal Binary Haplogroups , Genome Research, Vol. 12(2), 339-348, February 2002. (Detailed hierarchical chart has conversions from previous naming schemes) Semino et al. (2000), The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans , Science, Vol 290 (paper which introduced the "Eu" haplogroups). Y-DNA Ethnographic and Genographic Atlas and Open-Source Data Compilation
Mitokondrie-DNA haplogrupper PhyloTree - The phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation PhyloD3 - D3.js-based phylogenetic tree based on PhyloTree MitoTool - a web server for the analysis and retrieval of human mitochondrial DNA sequence variations HaploGrep - automatic classification of mitochondrial DNA haplogroups based on PhyloTree HaploFind - fast automatic haplogroup assignment pipeline for human mitochondrial DNA graphical mtDNA haplogroup skeleton The Making of the African mtDNA Landscape Do the Four Clades of the mtDNA Haplogroup L2 Evolve at Different Rates?
Software Y-DNA Haplogroup Browser
Kategori:DNA Kategori:Homo sapiens Kategori:Organismer Kategori:Genetik